Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HSD17B12Q53GQ0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HSD17B12Q53GQ0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.31■■□□□ 1
HSD17B12Q53GQ0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HSD17B12Q53GQ0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HSD17B12Q53GQ0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HSD17B12Q53GQ0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HSD17B12Q53GQ0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HSD17B12Q53GQ0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HSD17B12Q53GQ0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HSD17B12Q53GQ0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HSD17B12Q53GQ0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HSD17B12Q53GQ0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
HSD17B12Q53GQ0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HSD17B12Q53GQ0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HSD17B12Q53GQ0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HSD17B12Q53GQ0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HSD17B12Q53GQ0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HSD17B12Q53GQ0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HSD17B12Q53GQ0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HSD17B12Q53GQ0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HSD17B12Q53GQ0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HSD17B12Q53GQ0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
HSD17B12Q53GQ0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HSD17B12Q53GQ0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HSD17B12Q53GQ0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HSD17B12Q53GQ0 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
HSD17B12Q53GQ0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HSD17B12Q53GQ0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HSD17B12Q53GQ0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HSD17B12Q53GQ0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HSD17B12Q53GQ0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HSD17B12Q53GQ0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HSD17B12Q53GQ0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HSD17B12Q53GQ0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HSD17B12Q53GQ0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
HSD17B12Q53GQ0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HSD17B12Q53GQ0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HSD17B12Q53GQ0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HSD17B12Q53GQ0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HSD17B12Q53GQ0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HSD17B12Q53GQ0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HSD17B12Q53GQ0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HSD17B12Q53GQ0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HSD17B12Q53GQ0 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HSD17B12Q53GQ0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
HSD17B12Q53GQ0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HSD17B12Q53GQ0 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HSD17B12Q53GQ0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HSD17B12Q53GQ0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HSD17B12Q53GQ0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HSD17B12Q53GQ0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HSD17B12Q53GQ0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HSD17B12Q53GQ0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HSD17B12Q53GQ0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
HSD17B12Q53GQ0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HSD17B12Q53GQ0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HSD17B12Q53GQ0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HSD17B12Q53GQ0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HSD17B12Q53GQ0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HSD17B12Q53GQ0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HSD17B12Q53GQ0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HSD17B12Q53GQ0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HSD17B12Q53GQ0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
HSD17B12Q53GQ0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HSD17B12Q53GQ0 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HSD17B12Q53GQ0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HSD17B12Q53GQ0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HSD17B12Q53GQ0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
HSD17B12Q53GQ0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HSD17B12Q53GQ0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HSD17B12Q53GQ0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HSD17B12Q53GQ0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HSD17B12Q53GQ0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HSD17B12Q53GQ0 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HSD17B12Q53GQ0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HSD17B12Q53GQ0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HSD17B12Q53GQ0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HSD17B12Q53GQ0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HSD17B12Q53GQ0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HSD17B12Q53GQ0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HSD17B12Q53GQ0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HSD17B12Q53GQ0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HSD17B12Q53GQ0 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HSD17B12Q53GQ0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HSD17B12Q53GQ0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HSD17B12Q53GQ0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HSD17B12Q53GQ0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HSD17B12Q53GQ0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HSD17B12Q53GQ0 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HSD17B12Q53GQ0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HSD17B12Q53GQ0 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HSD17B12Q53GQ0 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HSD17B12Q53GQ0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HSD17B12Q53GQ0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HSD17B12Q53GQ0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HSD17B12Q53GQ0 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HSD17B12Q53GQ0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HSD17B12Q53GQ0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HSD17B12Q53GQ0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms