Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

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Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TPRNQ4KMQ1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TPRNQ4KMQ1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TPRNQ4KMQ1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TPRNQ4KMQ1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TPRNQ4KMQ1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TPRNQ4KMQ1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TPRNQ4KMQ1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TPRNQ4KMQ1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TPRNQ4KMQ1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TPRNQ4KMQ1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TPRNQ4KMQ1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TPRNQ4KMQ1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TPRNQ4KMQ1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TPRNQ4KMQ1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TPRNQ4KMQ1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TPRNQ4KMQ1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TPRNQ4KMQ1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TPRNQ4KMQ1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TPRNQ4KMQ1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TPRNQ4KMQ1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TPRNQ4KMQ1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TPRNQ4KMQ1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TPRNQ4KMQ1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
TPRNQ4KMQ1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
TPRNQ4KMQ1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TPRNQ4KMQ1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TPRNQ4KMQ1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TPRNQ4KMQ1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TPRNQ4KMQ1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TPRNQ4KMQ1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TPRNQ4KMQ1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TPRNQ4KMQ1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TPRNQ4KMQ1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TPRNQ4KMQ1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TPRNQ4KMQ1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TPRNQ4KMQ1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TPRNQ4KMQ1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
TPRNQ4KMQ1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
TPRNQ4KMQ1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TPRNQ4KMQ1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TPRNQ4KMQ1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TPRNQ4KMQ1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
TPRNQ4KMQ1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TPRNQ4KMQ1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TPRNQ4KMQ1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TPRNQ4KMQ1 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TPRNQ4KMQ1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TPRNQ4KMQ1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TPRNQ4KMQ1 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TPRNQ4KMQ1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TPRNQ4KMQ1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TPRNQ4KMQ1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TPRNQ4KMQ1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TPRNQ4KMQ1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TPRNQ4KMQ1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
TPRNQ4KMQ1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TPRNQ4KMQ1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TPRNQ4KMQ1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
TPRNQ4KMQ1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
TPRNQ4KMQ1 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
TPRNQ4KMQ1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TPRNQ4KMQ1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TPRNQ4KMQ1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TPRNQ4KMQ1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TPRNQ4KMQ1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TPRNQ4KMQ1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TPRNQ4KMQ1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TPRNQ4KMQ1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TPRNQ4KMQ1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TPRNQ4KMQ1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TPRNQ4KMQ1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TPRNQ4KMQ1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TPRNQ4KMQ1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TPRNQ4KMQ1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TPRNQ4KMQ1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TPRNQ4KMQ1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TPRNQ4KMQ1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TPRNQ4KMQ1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TPRNQ4KMQ1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TPRNQ4KMQ1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TPRNQ4KMQ1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TPRNQ4KMQ1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TPRNQ4KMQ1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TPRNQ4KMQ1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TPRNQ4KMQ1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TPRNQ4KMQ1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TPRNQ4KMQ1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TPRNQ4KMQ1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TPRNQ4KMQ1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TPRNQ4KMQ1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TPRNQ4KMQ1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TPRNQ4KMQ1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TPRNQ4KMQ1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TPRNQ4KMQ1 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TPRNQ4KMQ1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TPRNQ4KMQ1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TPRNQ4KMQ1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TPRNQ4KMQ1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TPRNQ4KMQ1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
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