Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0N0

GGTA1P, Inactive N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGTA1PQ4G0N0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GGTA1PQ4G0N0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GGTA1PQ4G0N0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GGTA1PQ4G0N0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GGTA1PQ4G0N0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GGTA1PQ4G0N0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GGTA1PQ4G0N0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GGTA1PQ4G0N0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GGTA1PQ4G0N0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GGTA1PQ4G0N0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GGTA1PQ4G0N0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GGTA1PQ4G0N0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GGTA1PQ4G0N0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GGTA1PQ4G0N0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GGTA1PQ4G0N0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GGTA1PQ4G0N0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GGTA1PQ4G0N0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GGTA1PQ4G0N0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GGTA1PQ4G0N0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GGTA1PQ4G0N0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GGTA1PQ4G0N0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GGTA1PQ4G0N0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GGTA1PQ4G0N0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GGTA1PQ4G0N0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GGTA1PQ4G0N0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GGTA1PQ4G0N0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GGTA1PQ4G0N0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GGTA1PQ4G0N0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GGTA1PQ4G0N0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GGTA1PQ4G0N0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GGTA1PQ4G0N0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GGTA1PQ4G0N0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GGTA1PQ4G0N0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GGTA1PQ4G0N0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GGTA1PQ4G0N0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GGTA1PQ4G0N0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GGTA1PQ4G0N0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GGTA1PQ4G0N0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GGTA1PQ4G0N0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GGTA1PQ4G0N0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GGTA1PQ4G0N0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GGTA1PQ4G0N0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GGTA1PQ4G0N0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GGTA1PQ4G0N0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GGTA1PQ4G0N0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GGTA1PQ4G0N0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GGTA1PQ4G0N0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GGTA1PQ4G0N0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GGTA1PQ4G0N0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GGTA1PQ4G0N0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GGTA1PQ4G0N0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GGTA1PQ4G0N0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GGTA1PQ4G0N0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GGTA1PQ4G0N0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GGTA1PQ4G0N0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GGTA1PQ4G0N0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GGTA1PQ4G0N0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GGTA1PQ4G0N0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GGTA1PQ4G0N0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GGTA1PQ4G0N0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GGTA1PQ4G0N0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GGTA1PQ4G0N0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GGTA1PQ4G0N0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GGTA1PQ4G0N0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GGTA1PQ4G0N0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GGTA1PQ4G0N0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GGTA1PQ4G0N0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GGTA1PQ4G0N0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GGTA1PQ4G0N0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GGTA1PQ4G0N0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GGTA1PQ4G0N0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GGTA1PQ4G0N0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GGTA1PQ4G0N0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GGTA1PQ4G0N0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GGTA1PQ4G0N0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GGTA1PQ4G0N0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GGTA1PQ4G0N0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GGTA1PQ4G0N0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GGTA1PQ4G0N0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GGTA1PQ4G0N0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GGTA1PQ4G0N0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GGTA1PQ4G0N0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
GGTA1PQ4G0N0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GGTA1PQ4G0N0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GGTA1PQ4G0N0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GGTA1PQ4G0N0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GGTA1PQ4G0N0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GGTA1PQ4G0N0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GGTA1PQ4G0N0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GGTA1PQ4G0N0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GGTA1PQ4G0N0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GGTA1PQ4G0N0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GGTA1PQ4G0N0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GGTA1PQ4G0N0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GGTA1PQ4G0N0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GGTA1PQ4G0N0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GGTA1PQ4G0N0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GGTA1PQ4G0N0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GGTA1PQ4G0N0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GGTA1PQ4G0N0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
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