Protein–RNA interactions for Protein: Q495N2

SLC36A3, Proton-coupled amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC36A3Q495N2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC36A3Q495N2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC36A3Q495N2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC36A3Q495N2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC36A3Q495N2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC36A3Q495N2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC36A3Q495N2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC36A3Q495N2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC36A3Q495N2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC36A3Q495N2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC36A3Q495N2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC36A3Q495N2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC36A3Q495N2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC36A3Q495N2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC36A3Q495N2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC36A3Q495N2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC36A3Q495N2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC36A3Q495N2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC36A3Q495N2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC36A3Q495N2 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC36A3Q495N2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC36A3Q495N2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC36A3Q495N2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC36A3Q495N2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC36A3Q495N2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC36A3Q495N2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC36A3Q495N2 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC36A3Q495N2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC36A3Q495N2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC36A3Q495N2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC36A3Q495N2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC36A3Q495N2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC36A3Q495N2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC36A3Q495N2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC36A3Q495N2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC36A3Q495N2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC36A3Q495N2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC36A3Q495N2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC36A3Q495N2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC36A3Q495N2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC36A3Q495N2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC36A3Q495N2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC36A3Q495N2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC36A3Q495N2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC36A3Q495N2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC36A3Q495N2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC36A3Q495N2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC36A3Q495N2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC36A3Q495N2 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC36A3Q495N2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC36A3Q495N2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC36A3Q495N2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC36A3Q495N2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC36A3Q495N2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC36A3Q495N2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC36A3Q495N2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC36A3Q495N2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC36A3Q495N2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC36A3Q495N2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC36A3Q495N2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC36A3Q495N2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC36A3Q495N2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC36A3Q495N2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC36A3Q495N2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC36A3Q495N2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC36A3Q495N2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC36A3Q495N2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC36A3Q495N2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC36A3Q495N2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC36A3Q495N2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC36A3Q495N2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC36A3Q495N2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC36A3Q495N2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC36A3Q495N2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC36A3Q495N2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SLC36A3Q495N2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SLC36A3Q495N2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC36A3Q495N2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC36A3Q495N2 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC36A3Q495N2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC36A3Q495N2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC36A3Q495N2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC36A3Q495N2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC36A3Q495N2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC36A3Q495N2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC36A3Q495N2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC36A3Q495N2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC36A3Q495N2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC36A3Q495N2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC36A3Q495N2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC36A3Q495N2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC36A3Q495N2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC36A3Q495N2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC36A3Q495N2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC36A3Q495N2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC36A3Q495N2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC36A3Q495N2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC36A3Q495N2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC36A3Q495N2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC36A3Q495N2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms