Protein–RNA interactions for Protein: Q29980

MICB, MHC class I polypeptide-related sequence B, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICBQ29980 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MICBQ29980 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MICBQ29980 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MICBQ29980 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MICBQ29980 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MICBQ29980 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MICBQ29980 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MICBQ29980 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MICBQ29980 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MICBQ29980 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MICBQ29980 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MICBQ29980 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MICBQ29980 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MICBQ29980 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MICBQ29980 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MICBQ29980 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MICBQ29980 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
MICBQ29980 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MICBQ29980 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MICBQ29980 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MICBQ29980 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MICBQ29980 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MICBQ29980 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MICBQ29980 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MICBQ29980 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MICBQ29980 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MICBQ29980 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MICBQ29980 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MICBQ29980 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MICBQ29980 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MICBQ29980 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MICBQ29980 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MICBQ29980 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MICBQ29980 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MICBQ29980 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MICBQ29980 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MICBQ29980 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MICBQ29980 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MICBQ29980 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MICBQ29980 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MICBQ29980 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MICBQ29980 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MICBQ29980 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MICBQ29980 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MICBQ29980 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MICBQ29980 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MICBQ29980 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MICBQ29980 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MICBQ29980 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MICBQ29980 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MICBQ29980 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
MICBQ29980 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MICBQ29980 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
MICBQ29980 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MICBQ29980 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
MICBQ29980 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MICBQ29980 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
MICBQ29980 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
MICBQ29980 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
MICBQ29980 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MICBQ29980 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
MICBQ29980 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MICBQ29980 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MICBQ29980 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MICBQ29980 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MICBQ29980 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MICBQ29980 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MICBQ29980 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MICBQ29980 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MICBQ29980 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MICBQ29980 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MICBQ29980 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MICBQ29980 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MICBQ29980 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
MICBQ29980 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MICBQ29980 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MICBQ29980 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MICBQ29980 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MICBQ29980 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MICBQ29980 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MICBQ29980 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MICBQ29980 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MICBQ29980 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MICBQ29980 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MICBQ29980 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MICBQ29980 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MICBQ29980 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MICBQ29980 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MICBQ29980 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MICBQ29980 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
MICBQ29980 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MICBQ29980 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MICBQ29980 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
MICBQ29980 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
MICBQ29980 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
MICBQ29980 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
MICBQ29980 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
MICBQ29980 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
MICBQ29980 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MICBQ29980 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms