Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KNOP1Q1ED39 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KNOP1Q1ED39 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KNOP1Q1ED39 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KNOP1Q1ED39 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KNOP1Q1ED39 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KNOP1Q1ED39 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KNOP1Q1ED39 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KNOP1Q1ED39 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KNOP1Q1ED39 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KNOP1Q1ED39 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KNOP1Q1ED39 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
KNOP1Q1ED39 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KNOP1Q1ED39 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KNOP1Q1ED39 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KNOP1Q1ED39 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KNOP1Q1ED39 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KNOP1Q1ED39 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KNOP1Q1ED39 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KNOP1Q1ED39 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KNOP1Q1ED39 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KNOP1Q1ED39 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KNOP1Q1ED39 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KNOP1Q1ED39 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KNOP1Q1ED39 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KNOP1Q1ED39 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KNOP1Q1ED39 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KNOP1Q1ED39 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KNOP1Q1ED39 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KNOP1Q1ED39 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KNOP1Q1ED39 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KNOP1Q1ED39 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
KNOP1Q1ED39 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
KNOP1Q1ED39 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KNOP1Q1ED39 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KNOP1Q1ED39 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
KNOP1Q1ED39 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
KNOP1Q1ED39 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KNOP1Q1ED39 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KNOP1Q1ED39 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KNOP1Q1ED39 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KNOP1Q1ED39 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KNOP1Q1ED39 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KNOP1Q1ED39 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
KNOP1Q1ED39 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KNOP1Q1ED39 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KNOP1Q1ED39 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
KNOP1Q1ED39 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KNOP1Q1ED39 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KNOP1Q1ED39 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
KNOP1Q1ED39 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KNOP1Q1ED39 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KNOP1Q1ED39 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KNOP1Q1ED39 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KNOP1Q1ED39 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KNOP1Q1ED39 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KNOP1Q1ED39 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KNOP1Q1ED39 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KNOP1Q1ED39 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KNOP1Q1ED39 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KNOP1Q1ED39 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KNOP1Q1ED39 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KNOP1Q1ED39 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KNOP1Q1ED39 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KNOP1Q1ED39 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KNOP1Q1ED39 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KNOP1Q1ED39 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KNOP1Q1ED39 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
KNOP1Q1ED39 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KNOP1Q1ED39 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KNOP1Q1ED39 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KNOP1Q1ED39 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
KNOP1Q1ED39 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
KNOP1Q1ED39 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
KNOP1Q1ED39 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
KNOP1Q1ED39 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KNOP1Q1ED39 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KNOP1Q1ED39 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KNOP1Q1ED39 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KNOP1Q1ED39 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KNOP1Q1ED39 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
KNOP1Q1ED39 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
KNOP1Q1ED39 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
KNOP1Q1ED39 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
KNOP1Q1ED39 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
KNOP1Q1ED39 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KNOP1Q1ED39 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KNOP1Q1ED39 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
KNOP1Q1ED39 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KNOP1Q1ED39 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KNOP1Q1ED39 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
KNOP1Q1ED39 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KNOP1Q1ED39 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
KNOP1Q1ED39 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KNOP1Q1ED39 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
KNOP1Q1ED39 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
KNOP1Q1ED39 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KNOP1Q1ED39 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KNOP1Q1ED39 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
KNOP1Q1ED39 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
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