Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZFHX3Q15911 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZFHX3Q15911 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZFHX3Q15911 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZFHX3Q15911 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZFHX3Q15911 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZFHX3Q15911 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZFHX3Q15911 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZFHX3Q15911 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZFHX3Q15911 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZFHX3Q15911 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ZFHX3Q15911 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZFHX3Q15911 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZFHX3Q15911 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ZFHX3Q15911 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZFHX3Q15911 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZFHX3Q15911 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZFHX3Q15911 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZFHX3Q15911 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZFHX3Q15911 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZFHX3Q15911 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZFHX3Q15911 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZFHX3Q15911 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZFHX3Q15911 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZFHX3Q15911 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZFHX3Q15911 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZFHX3Q15911 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZFHX3Q15911 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZFHX3Q15911 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ZFHX3Q15911 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
ZFHX3Q15911 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ZFHX3Q15911 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZFHX3Q15911 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZFHX3Q15911 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZFHX3Q15911 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZFHX3Q15911 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZFHX3Q15911 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZFHX3Q15911 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZFHX3Q15911 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZFHX3Q15911 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZFHX3Q15911 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZFHX3Q15911 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZFHX3Q15911 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZFHX3Q15911 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZFHX3Q15911 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZFHX3Q15911 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZFHX3Q15911 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZFHX3Q15911 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZFHX3Q15911 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZFHX3Q15911 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZFHX3Q15911 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZFHX3Q15911 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZFHX3Q15911 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ZFHX3Q15911 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZFHX3Q15911 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZFHX3Q15911 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZFHX3Q15911 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZFHX3Q15911 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ZFHX3Q15911 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZFHX3Q15911 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZFHX3Q15911 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZFHX3Q15911 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZFHX3Q15911 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZFHX3Q15911 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZFHX3Q15911 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ZFHX3Q15911 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ZFHX3Q15911 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ZFHX3Q15911 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZFHX3Q15911 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZFHX3Q15911 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZFHX3Q15911 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZFHX3Q15911 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ZFHX3Q15911 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZFHX3Q15911 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZFHX3Q15911 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZFHX3Q15911 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ZFHX3Q15911 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZFHX3Q15911 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ZFHX3Q15911 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZFHX3Q15911 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZFHX3Q15911 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZFHX3Q15911 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ZFHX3Q15911 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZFHX3Q15911 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZFHX3Q15911 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZFHX3Q15911 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ZFHX3Q15911 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZFHX3Q15911 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZFHX3Q15911 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZFHX3Q15911 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZFHX3Q15911 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZFHX3Q15911 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZFHX3Q15911 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ZFHX3Q15911 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZFHX3Q15911 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZFHX3Q15911 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZFHX3Q15911 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZFHX3Q15911 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZFHX3Q15911 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZFHX3Q15911 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
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