Protein–RNA interactions for Protein: Q15653

NFKBIB, NF-kappa-B inhibitor beta, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIBQ15653 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NFKBIBQ15653 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NFKBIBQ15653 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NFKBIBQ15653 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
NFKBIBQ15653 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NFKBIBQ15653 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NFKBIBQ15653 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NFKBIBQ15653 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NFKBIBQ15653 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NFKBIBQ15653 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NFKBIBQ15653 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NFKBIBQ15653 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NFKBIBQ15653 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NFKBIBQ15653 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NFKBIBQ15653 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NFKBIBQ15653 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NFKBIBQ15653 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NFKBIBQ15653 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NFKBIBQ15653 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NFKBIBQ15653 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NFKBIBQ15653 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NFKBIBQ15653 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NFKBIBQ15653 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NFKBIBQ15653 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NFKBIBQ15653 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NFKBIBQ15653 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NFKBIBQ15653 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NFKBIBQ15653 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NFKBIBQ15653 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NFKBIBQ15653 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NFKBIBQ15653 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NFKBIBQ15653 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NFKBIBQ15653 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NFKBIBQ15653 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NFKBIBQ15653 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NFKBIBQ15653 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
NFKBIBQ15653 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
NFKBIBQ15653 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
NFKBIBQ15653 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
NFKBIBQ15653 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
NFKBIBQ15653 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
NFKBIBQ15653 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NFKBIBQ15653 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NFKBIBQ15653 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NFKBIBQ15653 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NFKBIBQ15653 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NFKBIBQ15653 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NFKBIBQ15653 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NFKBIBQ15653 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
NFKBIBQ15653 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NFKBIBQ15653 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NFKBIBQ15653 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NFKBIBQ15653 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NFKBIBQ15653 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NFKBIBQ15653 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NFKBIBQ15653 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
NFKBIBQ15653 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
NFKBIBQ15653 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NFKBIBQ15653 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NFKBIBQ15653 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NFKBIBQ15653 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NFKBIBQ15653 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NFKBIBQ15653 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NFKBIBQ15653 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NFKBIBQ15653 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NFKBIBQ15653 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NFKBIBQ15653 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NFKBIBQ15653 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NFKBIBQ15653 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NFKBIBQ15653 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NFKBIBQ15653 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NFKBIBQ15653 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NFKBIBQ15653 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NFKBIBQ15653 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NFKBIBQ15653 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
NFKBIBQ15653 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NFKBIBQ15653 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NFKBIBQ15653 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NFKBIBQ15653 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NFKBIBQ15653 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NFKBIBQ15653 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NFKBIBQ15653 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NFKBIBQ15653 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NFKBIBQ15653 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NFKBIBQ15653 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NFKBIBQ15653 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NFKBIBQ15653 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NFKBIBQ15653 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NFKBIBQ15653 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NFKBIBQ15653 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NFKBIBQ15653 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NFKBIBQ15653 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NFKBIBQ15653 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NFKBIBQ15653 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NFKBIBQ15653 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NFKBIBQ15653 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NFKBIBQ15653 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
NFKBIBQ15653 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
NFKBIBQ15653 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NFKBIBQ15653 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms