Protein–RNA interactions for Protein: Q15198

PDGFRL, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRLQ15198 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PDGFRLQ15198 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PDGFRLQ15198 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PDGFRLQ15198 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PDGFRLQ15198 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDGFRLQ15198 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDGFRLQ15198 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDGFRLQ15198 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PDGFRLQ15198 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDGFRLQ15198 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PDGFRLQ15198 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDGFRLQ15198 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDGFRLQ15198 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDGFRLQ15198 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDGFRLQ15198 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDGFRLQ15198 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDGFRLQ15198 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDGFRLQ15198 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDGFRLQ15198 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDGFRLQ15198 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDGFRLQ15198 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDGFRLQ15198 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDGFRLQ15198 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDGFRLQ15198 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDGFRLQ15198 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDGFRLQ15198 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDGFRLQ15198 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDGFRLQ15198 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDGFRLQ15198 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PDGFRLQ15198 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDGFRLQ15198 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDGFRLQ15198 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDGFRLQ15198 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDGFRLQ15198 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDGFRLQ15198 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDGFRLQ15198 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDGFRLQ15198 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDGFRLQ15198 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PDGFRLQ15198 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDGFRLQ15198 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDGFRLQ15198 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDGFRLQ15198 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDGFRLQ15198 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDGFRLQ15198 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDGFRLQ15198 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PDGFRLQ15198 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PDGFRLQ15198 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDGFRLQ15198 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDGFRLQ15198 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDGFRLQ15198 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PDGFRLQ15198 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDGFRLQ15198 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDGFRLQ15198 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDGFRLQ15198 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDGFRLQ15198 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDGFRLQ15198 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDGFRLQ15198 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDGFRLQ15198 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDGFRLQ15198 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDGFRLQ15198 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PDGFRLQ15198 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDGFRLQ15198 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDGFRLQ15198 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDGFRLQ15198 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDGFRLQ15198 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDGFRLQ15198 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDGFRLQ15198 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDGFRLQ15198 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDGFRLQ15198 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDGFRLQ15198 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDGFRLQ15198 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDGFRLQ15198 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PDGFRLQ15198 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDGFRLQ15198 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDGFRLQ15198 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDGFRLQ15198 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDGFRLQ15198 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDGFRLQ15198 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDGFRLQ15198 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDGFRLQ15198 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDGFRLQ15198 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDGFRLQ15198 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDGFRLQ15198 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDGFRLQ15198 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PDGFRLQ15198 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
PDGFRLQ15198 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PDGFRLQ15198 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PDGFRLQ15198 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDGFRLQ15198 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDGFRLQ15198 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDGFRLQ15198 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDGFRLQ15198 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDGFRLQ15198 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDGFRLQ15198 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDGFRLQ15198 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDGFRLQ15198 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDGFRLQ15198 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDGFRLQ15198 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDGFRLQ15198 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDGFRLQ15198 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
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