Protein–RNA interactions for Protein: Q15118

PDK1, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK1Q15118 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDK1Q15118 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDK1Q15118 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDK1Q15118 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDK1Q15118 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDK1Q15118 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDK1Q15118 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PDK1Q15118 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDK1Q15118 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDK1Q15118 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDK1Q15118 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PDK1Q15118 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDK1Q15118 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDK1Q15118 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDK1Q15118 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDK1Q15118 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDK1Q15118 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDK1Q15118 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PDK1Q15118 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDK1Q15118 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDK1Q15118 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDK1Q15118 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PDK1Q15118 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDK1Q15118 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDK1Q15118 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDK1Q15118 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDK1Q15118 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
PDK1Q15118 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PDK1Q15118 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PDK1Q15118 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDK1Q15118 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDK1Q15118 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDK1Q15118 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PDK1Q15118 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDK1Q15118 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDK1Q15118 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDK1Q15118 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDK1Q15118 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDK1Q15118 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDK1Q15118 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDK1Q15118 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDK1Q15118 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDK1Q15118 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDK1Q15118 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDK1Q15118 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDK1Q15118 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDK1Q15118 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDK1Q15118 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDK1Q15118 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDK1Q15118 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDK1Q15118 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDK1Q15118 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDK1Q15118 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDK1Q15118 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDK1Q15118 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDK1Q15118 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDK1Q15118 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PDK1Q15118 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDK1Q15118 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDK1Q15118 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDK1Q15118 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDK1Q15118 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PDK1Q15118 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDK1Q15118 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDK1Q15118 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDK1Q15118 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDK1Q15118 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDK1Q15118 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PDK1Q15118 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDK1Q15118 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDK1Q15118 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDK1Q15118 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDK1Q15118 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDK1Q15118 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDK1Q15118 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDK1Q15118 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDK1Q15118 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDK1Q15118 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PDK1Q15118 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PDK1Q15118 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDK1Q15118 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDK1Q15118 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDK1Q15118 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDK1Q15118 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDK1Q15118 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDK1Q15118 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDK1Q15118 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDK1Q15118 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDK1Q15118 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PDK1Q15118 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDK1Q15118 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDK1Q15118 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDK1Q15118 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDK1Q15118 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDK1Q15118 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDK1Q15118 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDK1Q15118 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDK1Q15118 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDK1Q15118 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDK1Q15118 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms