Protein–RNA interactions for Protein: Q14680

MELK, Maternal embryonic leucine zipper kinase, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MELKQ14680 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MELKQ14680 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MELKQ14680 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MELKQ14680 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MELKQ14680 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MELKQ14680 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MELKQ14680 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MELKQ14680 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MELKQ14680 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MELKQ14680 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MELKQ14680 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MELKQ14680 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MELKQ14680 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MELKQ14680 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MELKQ14680 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MELKQ14680 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MELKQ14680 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MELKQ14680 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MELKQ14680 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MELKQ14680 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MELKQ14680 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MELKQ14680 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MELKQ14680 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MELKQ14680 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MELKQ14680 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MELKQ14680 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
MELKQ14680 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MELKQ14680 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MELKQ14680 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MELKQ14680 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MELKQ14680 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MELKQ14680 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MELKQ14680 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MELKQ14680 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MELKQ14680 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MELKQ14680 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MELKQ14680 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MELKQ14680 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MELKQ14680 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MELKQ14680 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MELKQ14680 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MELKQ14680 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MELKQ14680 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MELKQ14680 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MELKQ14680 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MELKQ14680 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MELKQ14680 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MELKQ14680 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MELKQ14680 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MELKQ14680 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MELKQ14680 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MELKQ14680 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MELKQ14680 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MELKQ14680 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MELKQ14680 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MELKQ14680 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MELKQ14680 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MELKQ14680 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
MELKQ14680 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MELKQ14680 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MELKQ14680 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MELKQ14680 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
MELKQ14680 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
MELKQ14680 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MELKQ14680 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MELKQ14680 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
MELKQ14680 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MELKQ14680 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MELKQ14680 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MELKQ14680 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MELKQ14680 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MELKQ14680 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MELKQ14680 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MELKQ14680 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MELKQ14680 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MELKQ14680 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MELKQ14680 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MELKQ14680 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MELKQ14680 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
MELKQ14680 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MELKQ14680 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MELKQ14680 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MELKQ14680 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MELKQ14680 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MELKQ14680 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MELKQ14680 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MELKQ14680 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MELKQ14680 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MELKQ14680 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MELKQ14680 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MELKQ14680 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MELKQ14680 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MELKQ14680 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MELKQ14680 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MELKQ14680 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MELKQ14680 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MELKQ14680 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MELKQ14680 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MELKQ14680 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MELKQ14680 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms