Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

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Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEMA3AQ14563 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEMA3AQ14563 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEMA3AQ14563 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEMA3AQ14563 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEMA3AQ14563 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEMA3AQ14563 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEMA3AQ14563 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEMA3AQ14563 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEMA3AQ14563 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEMA3AQ14563 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEMA3AQ14563 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SEMA3AQ14563 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEMA3AQ14563 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEMA3AQ14563 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEMA3AQ14563 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEMA3AQ14563 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEMA3AQ14563 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEMA3AQ14563 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEMA3AQ14563 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEMA3AQ14563 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEMA3AQ14563 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEMA3AQ14563 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEMA3AQ14563 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEMA3AQ14563 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEMA3AQ14563 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEMA3AQ14563 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEMA3AQ14563 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SEMA3AQ14563 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEMA3AQ14563 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SEMA3AQ14563 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEMA3AQ14563 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEMA3AQ14563 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEMA3AQ14563 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SEMA3AQ14563 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEMA3AQ14563 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEMA3AQ14563 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEMA3AQ14563 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SEMA3AQ14563 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEMA3AQ14563 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEMA3AQ14563 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEMA3AQ14563 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEMA3AQ14563 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEMA3AQ14563 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEMA3AQ14563 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEMA3AQ14563 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEMA3AQ14563 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEMA3AQ14563 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEMA3AQ14563 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEMA3AQ14563 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEMA3AQ14563 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEMA3AQ14563 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEMA3AQ14563 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEMA3AQ14563 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEMA3AQ14563 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEMA3AQ14563 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEMA3AQ14563 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEMA3AQ14563 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEMA3AQ14563 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SEMA3AQ14563 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEMA3AQ14563 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SEMA3AQ14563 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEMA3AQ14563 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEMA3AQ14563 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEMA3AQ14563 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEMA3AQ14563 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEMA3AQ14563 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEMA3AQ14563 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEMA3AQ14563 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEMA3AQ14563 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEMA3AQ14563 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEMA3AQ14563 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEMA3AQ14563 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEMA3AQ14563 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEMA3AQ14563 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEMA3AQ14563 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEMA3AQ14563 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEMA3AQ14563 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEMA3AQ14563 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEMA3AQ14563 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEMA3AQ14563 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEMA3AQ14563 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEMA3AQ14563 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEMA3AQ14563 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SEMA3AQ14563 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEMA3AQ14563 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEMA3AQ14563 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEMA3AQ14563 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEMA3AQ14563 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEMA3AQ14563 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEMA3AQ14563 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
SEMA3AQ14563 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SEMA3AQ14563 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SEMA3AQ14563 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SEMA3AQ14563 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SEMA3AQ14563 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SEMA3AQ14563 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEMA3AQ14563 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEMA3AQ14563 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEMA3AQ14563 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
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