Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
COL4A6Q14031 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
COL4A6Q14031 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
COL4A6Q14031 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
COL4A6Q14031 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
COL4A6Q14031 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
COL4A6Q14031 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
COL4A6Q14031 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
COL4A6Q14031 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
COL4A6Q14031 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
COL4A6Q14031 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
COL4A6Q14031 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
COL4A6Q14031 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
COL4A6Q14031 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
COL4A6Q14031 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
COL4A6Q14031 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
COL4A6Q14031 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
COL4A6Q14031 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
COL4A6Q14031 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
COL4A6Q14031 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
COL4A6Q14031 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
COL4A6Q14031 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
COL4A6Q14031 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
COL4A6Q14031 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
COL4A6Q14031 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
COL4A6Q14031 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
COL4A6Q14031 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
COL4A6Q14031 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
COL4A6Q14031 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
COL4A6Q14031 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
COL4A6Q14031 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
COL4A6Q14031 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
COL4A6Q14031 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
COL4A6Q14031 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
COL4A6Q14031 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
COL4A6Q14031 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
COL4A6Q14031 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
COL4A6Q14031 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
COL4A6Q14031 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
COL4A6Q14031 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
COL4A6Q14031 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
COL4A6Q14031 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
COL4A6Q14031 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
COL4A6Q14031 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
COL4A6Q14031 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
COL4A6Q14031 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
COL4A6Q14031 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
COL4A6Q14031 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
COL4A6Q14031 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
COL4A6Q14031 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
COL4A6Q14031 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
COL4A6Q14031 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
COL4A6Q14031 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
COL4A6Q14031 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
COL4A6Q14031 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
COL4A6Q14031 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
COL4A6Q14031 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
COL4A6Q14031 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
COL4A6Q14031 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
COL4A6Q14031 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
COL4A6Q14031 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
COL4A6Q14031 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
COL4A6Q14031 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
COL4A6Q14031 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
COL4A6Q14031 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
COL4A6Q14031 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
COL4A6Q14031 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
COL4A6Q14031 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
COL4A6Q14031 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
COL4A6Q14031 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
COL4A6Q14031 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
COL4A6Q14031 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
COL4A6Q14031 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
COL4A6Q14031 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
COL4A6Q14031 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
COL4A6Q14031 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
COL4A6Q14031 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
COL4A6Q14031 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
COL4A6Q14031 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
COL4A6Q14031 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
COL4A6Q14031 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
COL4A6Q14031 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
COL4A6Q14031 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
COL4A6Q14031 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
COL4A6Q14031 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
COL4A6Q14031 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
COL4A6Q14031 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
COL4A6Q14031 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
COL4A6Q14031 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
COL4A6Q14031 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
COL4A6Q14031 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
COL4A6Q14031 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
COL4A6Q14031 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
COL4A6Q14031 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
COL4A6Q14031 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
COL4A6Q14031 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
COL4A6Q14031 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
COL4A6Q14031 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
COL4A6Q14031 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
COL4A6Q14031 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
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