Protein–RNA interactions for Protein: Q14003

KCNC3, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 3, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC3Q14003 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KCNC3Q14003 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KCNC3Q14003 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KCNC3Q14003 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KCNC3Q14003 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KCNC3Q14003 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KCNC3Q14003 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KCNC3Q14003 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KCNC3Q14003 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KCNC3Q14003 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KCNC3Q14003 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KCNC3Q14003 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
KCNC3Q14003 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
KCNC3Q14003 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
KCNC3Q14003 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
KCNC3Q14003 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
KCNC3Q14003 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KCNC3Q14003 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KCNC3Q14003 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
KCNC3Q14003 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KCNC3Q14003 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KCNC3Q14003 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KCNC3Q14003 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KCNC3Q14003 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KCNC3Q14003 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
KCNC3Q14003 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KCNC3Q14003 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KCNC3Q14003 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KCNC3Q14003 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KCNC3Q14003 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KCNC3Q14003 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KCNC3Q14003 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KCNC3Q14003 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KCNC3Q14003 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KCNC3Q14003 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KCNC3Q14003 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KCNC3Q14003 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
KCNC3Q14003 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KCNC3Q14003 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KCNC3Q14003 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KCNC3Q14003 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KCNC3Q14003 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KCNC3Q14003 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KCNC3Q14003 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KCNC3Q14003 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
KCNC3Q14003 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KCNC3Q14003 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KCNC3Q14003 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KCNC3Q14003 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
KCNC3Q14003 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
KCNC3Q14003 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KCNC3Q14003 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
KCNC3Q14003 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KCNC3Q14003 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KCNC3Q14003 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KCNC3Q14003 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KCNC3Q14003 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KCNC3Q14003 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KCNC3Q14003 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KCNC3Q14003 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KCNC3Q14003 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KCNC3Q14003 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KCNC3Q14003 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KCNC3Q14003 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KCNC3Q14003 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KCNC3Q14003 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KCNC3Q14003 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KCNC3Q14003 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KCNC3Q14003 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KCNC3Q14003 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KCNC3Q14003 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KCNC3Q14003 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KCNC3Q14003 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KCNC3Q14003 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KCNC3Q14003 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KCNC3Q14003 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KCNC3Q14003 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KCNC3Q14003 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KCNC3Q14003 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KCNC3Q14003 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KCNC3Q14003 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KCNC3Q14003 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KCNC3Q14003 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KCNC3Q14003 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNC3Q14003 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNC3Q14003 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNC3Q14003 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNC3Q14003 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNC3Q14003 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNC3Q14003 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNC3Q14003 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNC3Q14003 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNC3Q14003 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNC3Q14003 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNC3Q14003 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNC3Q14003 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNC3Q14003 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNC3Q14003 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KCNC3Q14003 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNC3Q14003 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
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