Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

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Length 388 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HTR4Q13639 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HTR4Q13639 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HTR4Q13639 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HTR4Q13639 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HTR4Q13639 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HTR4Q13639 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HTR4Q13639 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HTR4Q13639 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HTR4Q13639 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HTR4Q13639 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HTR4Q13639 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HTR4Q13639 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HTR4Q13639 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HTR4Q13639 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HTR4Q13639 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HTR4Q13639 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
HTR4Q13639 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HTR4Q13639 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HTR4Q13639 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HTR4Q13639 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HTR4Q13639 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
HTR4Q13639 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HTR4Q13639 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HTR4Q13639 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HTR4Q13639 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HTR4Q13639 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HTR4Q13639 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
HTR4Q13639 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HTR4Q13639 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
HTR4Q13639 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HTR4Q13639 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HTR4Q13639 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HTR4Q13639 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HTR4Q13639 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HTR4Q13639 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HTR4Q13639 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HTR4Q13639 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HTR4Q13639 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HTR4Q13639 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HTR4Q13639 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HTR4Q13639 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HTR4Q13639 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HTR4Q13639 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HTR4Q13639 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HTR4Q13639 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HTR4Q13639 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HTR4Q13639 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HTR4Q13639 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HTR4Q13639 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HTR4Q13639 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HTR4Q13639 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HTR4Q13639 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HTR4Q13639 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HTR4Q13639 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HTR4Q13639 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HTR4Q13639 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HTR4Q13639 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HTR4Q13639 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HTR4Q13639 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HTR4Q13639 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HTR4Q13639 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HTR4Q13639 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HTR4Q13639 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HTR4Q13639 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HTR4Q13639 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HTR4Q13639 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HTR4Q13639 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HTR4Q13639 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HTR4Q13639 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HTR4Q13639 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HTR4Q13639 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
HTR4Q13639 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HTR4Q13639 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HTR4Q13639 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HTR4Q13639 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HTR4Q13639 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HTR4Q13639 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
HTR4Q13639 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
HTR4Q13639 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HTR4Q13639 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HTR4Q13639 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HTR4Q13639 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HTR4Q13639 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HTR4Q13639 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
HTR4Q13639 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HTR4Q13639 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HTR4Q13639 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HTR4Q13639 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HTR4Q13639 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HTR4Q13639 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HTR4Q13639 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HTR4Q13639 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HTR4Q13639 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HTR4Q13639 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HTR4Q13639 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HTR4Q13639 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HTR4Q13639 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HTR4Q13639 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HTR4Q13639 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
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