Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

Predictions only

Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATMQ13315 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATMQ13315 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATMQ13315 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATMQ13315 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ATMQ13315 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATMQ13315 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATMQ13315 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATMQ13315 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATMQ13315 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATMQ13315 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATMQ13315 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATMQ13315 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATMQ13315 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATMQ13315 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATMQ13315 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATMQ13315 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATMQ13315 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATMQ13315 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATMQ13315 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATMQ13315 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATMQ13315 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ATMQ13315 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATMQ13315 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATMQ13315 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATMQ13315 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATMQ13315 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATMQ13315 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATMQ13315 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATMQ13315 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATMQ13315 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATMQ13315 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATMQ13315 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATMQ13315 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATMQ13315 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ATMQ13315 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ATMQ13315 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATMQ13315 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATMQ13315 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATMQ13315 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATMQ13315 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATMQ13315 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATMQ13315 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATMQ13315 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATMQ13315 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATMQ13315 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATMQ13315 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATMQ13315 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATMQ13315 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATMQ13315 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATMQ13315 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATMQ13315 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATMQ13315 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATMQ13315 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATMQ13315 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATMQ13315 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ATMQ13315 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATMQ13315 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATMQ13315 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ATMQ13315 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATMQ13315 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ATMQ13315 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATMQ13315 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATMQ13315 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATMQ13315 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATMQ13315 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATMQ13315 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ATMQ13315 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATMQ13315 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATMQ13315 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATMQ13315 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATMQ13315 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATMQ13315 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATMQ13315 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATMQ13315 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATMQ13315 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATMQ13315 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATMQ13315 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATMQ13315 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATMQ13315 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATMQ13315 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATMQ13315 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATMQ13315 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATMQ13315 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATMQ13315 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATMQ13315 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATMQ13315 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATMQ13315 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATMQ13315 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ATMQ13315 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATMQ13315 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATMQ13315 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATMQ13315 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ATMQ13315 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATMQ13315 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATMQ13315 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATMQ13315 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ATMQ13315 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATMQ13315 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATMQ13315 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
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