Protein–RNA interactions for Protein: Q13148

TARDBP, TAR DNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARDBPQ13148 MIR4435-2HG-208ENST00000439494 707 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.095e-30■■■■■ 39.4
TARDBPQ13148 MIR4435-2HG-203ENST00000409569 514 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.215e-30■■■■■ 39.4
TARDBPQ13148 MIR4435-2HG-209ENST00000441075 704 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.495e-30■■■■■ 39.4
TARDBPQ13148 CLASP1-201ENST00000263710 8092 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.81e-6■■■■■ 39.3
TARDBPQ13148 CLASP1-203ENST00000409078 8002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.991e-6■■■■■ 39.3
TARDBPQ13148 CLASP1-215ENST00000541377 7909 ntTSL 5 BASIC8.82□□□□□ -11e-6■■■■■ 39.3
TARDBPQ13148 CLASP1-202ENST00000397587 7915 ntTSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.031e-6■■■■■ 39.3
TARDBPQ13148 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.162e-7■■■■■ 39.3
TARDBPQ13148 UBAC1-202ENST00000465873 882 ntTSL 216.34■□□□□ 0.219e-9■■■■■ 39.2
TARDBPQ13148 UBAC1-206ENST00000489050 864 ntTSL 310.12□□□□□ -0.799e-9■■■■■ 39.2
TARDBPQ13148 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.298e-16■■■■■ 39.2
TARDBPQ13148 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.138e-16■■■■■ 39.2
TARDBPQ13148 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.178e-16■■■■■ 39.2
TARDBPQ13148 ALAS2-207ENST00000493869 658 ntTSL 213.32□□□□□ -0.288e-16■■■■■ 39.2
TARDBPQ13148 ALAS2-205ENST00000463868 646 ntTSL 313.32□□□□□ -0.288e-16■■■■■ 39.2
TARDBPQ13148 ALAS2-206ENST00000477869 582 ntTSL 511.73□□□□□ -0.538e-16■■■■■ 39.2
TARDBPQ13148 ALAS2-204ENST00000455688 664 ntTSL 26.17□□□□□ -1.428e-16■■■■■ 39.2
TARDBPQ13148 CLOCK-210ENST00000513033 567 ntTSL 418■□□□□ 0.471e-9■■■■■ 39.1
TARDBPQ13148 CLOCK-203ENST00000435527 746 ntTSL 318■□□□□ 0.471e-9■■■■■ 39.1
TARDBPQ13148 CLOCK-208ENST00000509151 476 ntTSL 415.99■□□□□ 0.151e-9■■■■■ 39.1
TARDBPQ13148 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.271e-9■■■■■ 39.1
TARDBPQ13148 CLOCK-202ENST00000381322 4059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.081e-9■■■■■ 39.1
TARDBPQ13148 CLOCK-206ENST00000506923 616 ntTSL 33.29□□□□□ -1.881e-9■■■■■ 39.1
TARDBPQ13148 ZFPM2-208ENST00000522160 468 ntTSL 35.33□□□□□ -1.561e-11■■■■■ 39.1
TARDBPQ13148 WDR27-202ENST00000441385 683 ntTSL 313.02□□□□□ -0.334e-9■■■■■ 39.1
TARDBPQ13148 WDR27-211ENST00000546525 3511 ntTSL 1 (best)11.54□□□□□ -0.564e-9■■■■■ 39.1
TARDBPQ13148 WDR27-205ENST00000467418 947 ntTSL 59.9□□□□□ -0.824e-9■■■■■ 39.1
TARDBPQ13148 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.748e-7■■■■■ 39.1
TARDBPQ13148 GNB1L-206ENST00000481086 854 ntTSL 319.45■□□□□ 0.78e-7■■■■■ 39.1
TARDBPQ13148 GNB1L-205ENST00000460402 1197 ntTSL 318.2■□□□□ 0.58e-7■■■■■ 39.1
TARDBPQ13148 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.478e-7■■■■■ 39.1
TARDBPQ13148 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.258e-7■■■■■ 39.1
TARDBPQ13148 PRRC2B-202ENST00000357304 11042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.673e-12■■■■■ 39
TARDBPQ13148 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.032e-9■■■■■ 39
TARDBPQ13148 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.212e-9■■■■■ 39
TARDBPQ13148 VAMP2-201ENST00000316509 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.322e-9■■■■■ 39
TARDBPQ13148 PIGG-207ENST00000504187 1784 ntTSL 215.47■□□□□ 0.076e-10■■■■■ 38.9
TARDBPQ13148 PIGG-211ENST00000506402 2387 ntTSL 1 (best)14.32□□□□□ -0.126e-10■■■■■ 38.9
TARDBPQ13148 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.126e-10■■■■■ 38.9
TARDBPQ13148 PIGG-217ENST00000509768 3121 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.356e-10■■■■■ 38.9
TARDBPQ13148 PIGG-208ENST00000504346 3019 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.416e-10■■■■■ 38.9
TARDBPQ13148 PIGG-205ENST00000503111 2629 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.416e-10■■■■■ 38.9
TARDBPQ13148 PIGG-203ENST00000453061 3218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.516e-10■■■■■ 38.9
TARDBPQ13148 PIGG-201ENST00000310340 3203 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.526e-10■■■■■ 38.9
TARDBPQ13148 USP24-201ENST00000294383 10549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.518e-8■■■■■ 38.9
TARDBPQ13148 SRPK1-210ENST00000508473 858 ntTSL 224.04■■□□□ 1.445e-11■■■■■ 38.9
TARDBPQ13148 AGPAT4-204ENST00000436279 875 ntTSL 1 (best)10.62□□□□□ -0.715e-7■■■■■ 38.9
TARDBPQ13148 SRPK1-209ENST00000507909 581 ntTSL 49.36□□□□□ -0.915e-11■■■■■ 38.9
TARDBPQ13148 SRPK1-213ENST00000513367 634 ntTSL 26.69□□□□□ -1.345e-11■■■■■ 38.9
TARDBPQ13148 SRPK1-212ENST00000512445 559 ntTSL 56.6□□□□□ -1.355e-11■■■■■ 38.9
TARDBPQ13148 WDR26-201ENST00000414423 6872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.382e-8■■■■■ 38.9
TARDBPQ13148 WDR26-207ENST00000480676 1725 ntTSL 510.47□□□□□ -0.732e-8■■■■■ 38.9
TARDBPQ13148 PIGS-207ENST00000492429 2658 ntTSL 210.73□□□□□ -0.691e-6■■■■■ 38.9
TARDBPQ13148 PIGS-206ENST00000487231 3088 ntTSL 1 (best)10.67□□□□□ -0.71e-6■■■■■ 38.9
TARDBPQ13148 MACC1-201ENST00000332878 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.825e-7■■■■■ 38.8
TARDBPQ13148 LRCH4-205ENST00000485554 774 ntTSL 318.27■□□□□ 0.521e-12■■■■■ 38.8
TARDBPQ13148 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.141e-12■■■■■ 38.8
TARDBPQ13148 PRKACB-205ENST00000370688 1905 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.359e-12■■■■■ 38.8
TARDBPQ13148 PRKACB-206ENST00000370689 4513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.549e-12■■■■■ 38.8
TARDBPQ13148 NOL4L-201ENST00000201961 971 ntAPPRIS ALT2 TSL 323.88■■□□□ 1.418e-8■■■■■ 38.8
TARDBPQ13148 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.278e-8■■■■■ 38.8
TARDBPQ13148 RPTOR-206ENST00000573746 688 ntTSL 29.94□□□□□ -0.821e-9■■■■■ 38.8
TARDBPQ13148 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.014e-11■■■■■ 38.7
TARDBPQ13148 SRPK1-201ENST00000346162 4762 ntTSL 214.86□□□□□ -0.034e-11■■■■■ 38.7
TARDBPQ13148 SRPK1-202ENST00000361690 4286 ntTSL 1 (best)9.35□□□□□ -0.914e-11■■■■■ 38.7
TARDBPQ13148 SRPK1-205ENST00000423325 4357 ntTSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.974e-11■■■■■ 38.7
TARDBPQ13148 SRPK1-211ENST00000510290 621 ntTSL 36.81□□□□□ -1.324e-11■■■■■ 38.7
TARDBPQ13148 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.064e-8■■■■■ 38.7
TARDBPQ13148 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.584e-8■■■■■ 38.7
TARDBPQ13148 SRPK1-203ENST00000373821 565 ntTSL 53.46□□□□□ -1.862e-11■■■■■ 38.6
TARDBPQ13148 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.973e-7■■■■■ 38.6
TARDBPQ13148 ANKRD11-204ENST00000378332 1982 ntTSL 219.52■□□□□ 0.723e-7■■■■■ 38.6
TARDBPQ13148 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.293e-7■■■■■ 38.6
TARDBPQ13148 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.323e-7■■■■■ 38.6
TARDBPQ13148 ANKRD11-207ENST00000562816 573 ntTSL 411.81□□□□□ -0.523e-7■■■■■ 38.6
TARDBPQ13148 MDN1-201ENST00000369393 18413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.55e-8■■■■■ 38.6
TARDBPQ13148 HDAC7-222ENST00000477937 410 ntTSL 513.85□□□□□ -0.195e-10■■■■■ 38.5
TARDBPQ13148 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.35e-10■■■■■ 38.5
TARDBPQ13148 HDAC7-203ENST00000380610 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.385e-10■■■■■ 38.5
TARDBPQ13148 HDAC7-221ENST00000477203 3122 ntTSL 212.57□□□□□ -0.45e-10■■■■■ 38.5
TARDBPQ13148 HDAC7-230ENST00000552960 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.535e-10■■■■■ 38.5
TARDBPQ13148 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC14.6□□□□□ -0.077e-11■■■■■ 38.5
TARDBPQ13148 SCARB1-206ENST00000539320 720 ntTSL 222.43■■□□□ 1.182e-6■■■■■ 38.5
TARDBPQ13148 SCARB1-210ENST00000545493 581 ntTSL 221.35■■□□□ 1.012e-6■■■■■ 38.5
TARDBPQ13148 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.822e-6■■■■■ 38.5
TARDBPQ13148 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.542e-6■■■■■ 38.5
TARDBPQ13148 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.332e-6■■■■■ 38.5
TARDBPQ13148 SCARB1-205ENST00000538291 5527 ntTSL 516.47■□□□□ 0.232e-6■■■■■ 38.5
TARDBPQ13148 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.062e-6■■■■■ 38.5
TARDBPQ13148 SCARB1-207ENST00000541661 476 ntTSL 513.54□□□□□ -0.242e-6■■■■■ 38.5
TARDBPQ13148 SCARB1-204ENST00000535005 1845 ntTSL 1 (best)11.63□□□□□ -0.552e-6■■■■■ 38.5
TARDBPQ13148 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.914e-7■■■■■ 38.5
TARDBPQ13148 ANKLE2-207ENST00000539605 10890 ntTSL 1 (best)14.46□□□□□ -0.094e-7■■■■■ 38.5
TARDBPQ13148 RERE-203ENST00000400907 2973 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.193e-7■■■■■ 38.5
TARDBPQ13148 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.13e-6■■■■■ 38.5
TARDBPQ13148 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.535e-7■■■■■ 38.4
TARDBPQ13148 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.525e-7■■■■■ 38.4
TARDBPQ13148 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.385e-7■■■■■ 38.4
TARDBPQ13148 MAPK8IP3-203ENST00000561765 2374 ntTSL 1 (best)15.96■□□□□ 0.155e-7■■■■■ 38.4
TARDBPQ13148 MAPK8IP3-207ENST00000564098 4436 ntTSL 214.98□□□□□ -0.015e-7■■■■■ 38.4
Retrieved 100 of 14,326 protein–RNA pairs in 127.1 ms