Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXF1Q12946 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXF1Q12946 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXF1Q12946 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXF1Q12946 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXF1Q12946 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXF1Q12946 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXF1Q12946 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXF1Q12946 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXF1Q12946 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXF1Q12946 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXF1Q12946 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXF1Q12946 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXF1Q12946 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXF1Q12946 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXF1Q12946 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXF1Q12946 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXF1Q12946 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXF1Q12946 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXF1Q12946 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXF1Q12946 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXF1Q12946 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXF1Q12946 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXF1Q12946 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXF1Q12946 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXF1Q12946 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXF1Q12946 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXF1Q12946 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXF1Q12946 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXF1Q12946 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXF1Q12946 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXF1Q12946 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXF1Q12946 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXF1Q12946 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXF1Q12946 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXF1Q12946 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXF1Q12946 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXF1Q12946 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXF1Q12946 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXF1Q12946 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXF1Q12946 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXF1Q12946 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXF1Q12946 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXF1Q12946 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXF1Q12946 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXF1Q12946 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXF1Q12946 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXF1Q12946 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXF1Q12946 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXF1Q12946 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXF1Q12946 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXF1Q12946 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXF1Q12946 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXF1Q12946 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXF1Q12946 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXF1Q12946 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXF1Q12946 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXF1Q12946 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXF1Q12946 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXF1Q12946 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXF1Q12946 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXF1Q12946 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXF1Q12946 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXF1Q12946 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXF1Q12946 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXF1Q12946 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXF1Q12946 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXF1Q12946 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXF1Q12946 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXF1Q12946 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXF1Q12946 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
FOXF1Q12946 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXF1Q12946 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FOXF1Q12946 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FOXF1Q12946 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FOXF1Q12946 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FOXF1Q12946 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FOXF1Q12946 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FOXF1Q12946 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FOXF1Q12946 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXF1Q12946 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXF1Q12946 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXF1Q12946 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXF1Q12946 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXF1Q12946 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXF1Q12946 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXF1Q12946 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXF1Q12946 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXF1Q12946 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXF1Q12946 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXF1Q12946 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXF1Q12946 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXF1Q12946 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXF1Q12946 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXF1Q12946 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXF1Q12946 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXF1Q12946 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXF1Q12946 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FOXF1Q12946 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FOXF1Q12946 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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