Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
STX4Q12846 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
STX4Q12846 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
STX4Q12846 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
STX4Q12846 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
STX4Q12846 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
STX4Q12846 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
STX4Q12846 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
STX4Q12846 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
STX4Q12846 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
STX4Q12846 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
STX4Q12846 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
STX4Q12846 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
STX4Q12846 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
STX4Q12846 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
STX4Q12846 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
STX4Q12846 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
STX4Q12846 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
STX4Q12846 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
STX4Q12846 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
STX4Q12846 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
STX4Q12846 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
STX4Q12846 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
STX4Q12846 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
STX4Q12846 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
STX4Q12846 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
STX4Q12846 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
STX4Q12846 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
STX4Q12846 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
STX4Q12846 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
STX4Q12846 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
STX4Q12846 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
STX4Q12846 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
STX4Q12846 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
STX4Q12846 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
STX4Q12846 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
STX4Q12846 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
STX4Q12846 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
STX4Q12846 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
STX4Q12846 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
STX4Q12846 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
STX4Q12846 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
STX4Q12846 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
STX4Q12846 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
STX4Q12846 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
STX4Q12846 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
STX4Q12846 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
STX4Q12846 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
STX4Q12846 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
STX4Q12846 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
STX4Q12846 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
STX4Q12846 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
STX4Q12846 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
STX4Q12846 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
STX4Q12846 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
STX4Q12846 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
STX4Q12846 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
STX4Q12846 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
STX4Q12846 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
STX4Q12846 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
STX4Q12846 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
STX4Q12846 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
STX4Q12846 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
STX4Q12846 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
STX4Q12846 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
STX4Q12846 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
STX4Q12846 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
STX4Q12846 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
STX4Q12846 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
STX4Q12846 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
STX4Q12846 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
STX4Q12846 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
STX4Q12846 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
STX4Q12846 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
STX4Q12846 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
STX4Q12846 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
STX4Q12846 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
STX4Q12846 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
STX4Q12846 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
STX4Q12846 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
STX4Q12846 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
STX4Q12846 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
STX4Q12846 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
STX4Q12846 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
STX4Q12846 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
STX4Q12846 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
STX4Q12846 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
STX4Q12846 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
STX4Q12846 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
STX4Q12846 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
STX4Q12846 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
STX4Q12846 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
STX4Q12846 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
STX4Q12846 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
STX4Q12846 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
STX4Q12846 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
STX4Q12846 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
STX4Q12846 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
STX4Q12846 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
STX4Q12846 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms