Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB40BQ12829 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB40BQ12829 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB40BQ12829 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB40BQ12829 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB40BQ12829 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB40BQ12829 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB40BQ12829 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB40BQ12829 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB40BQ12829 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB40BQ12829 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB40BQ12829 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB40BQ12829 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB40BQ12829 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB40BQ12829 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB40BQ12829 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB40BQ12829 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB40BQ12829 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB40BQ12829 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB40BQ12829 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB40BQ12829 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB40BQ12829 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB40BQ12829 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB40BQ12829 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB40BQ12829 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB40BQ12829 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB40BQ12829 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB40BQ12829 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB40BQ12829 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB40BQ12829 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB40BQ12829 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB40BQ12829 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
RAB40BQ12829 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
RAB40BQ12829 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB40BQ12829 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB40BQ12829 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB40BQ12829 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB40BQ12829 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB40BQ12829 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB40BQ12829 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB40BQ12829 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB40BQ12829 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB40BQ12829 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB40BQ12829 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB40BQ12829 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB40BQ12829 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB40BQ12829 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB40BQ12829 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB40BQ12829 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB40BQ12829 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB40BQ12829 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB40BQ12829 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB40BQ12829 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB40BQ12829 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB40BQ12829 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB40BQ12829 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB40BQ12829 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB40BQ12829 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB40BQ12829 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB40BQ12829 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB40BQ12829 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB40BQ12829 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB40BQ12829 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB40BQ12829 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB40BQ12829 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB40BQ12829 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB40BQ12829 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB40BQ12829 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB40BQ12829 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB40BQ12829 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB40BQ12829 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB40BQ12829 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB40BQ12829 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB40BQ12829 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB40BQ12829 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB40BQ12829 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB40BQ12829 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB40BQ12829 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB40BQ12829 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB40BQ12829 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB40BQ12829 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB40BQ12829 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB40BQ12829 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RAB40BQ12829 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RAB40BQ12829 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RAB40BQ12829 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB40BQ12829 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB40BQ12829 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB40BQ12829 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB40BQ12829 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB40BQ12829 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB40BQ12829 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB40BQ12829 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB40BQ12829 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB40BQ12829 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB40BQ12829 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB40BQ12829 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB40BQ12829 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB40BQ12829 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB40BQ12829 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms