Protein–RNA interactions for Protein: Q12748

CTF3, Inner kinetochore subunit CTF3, yeastyeast

Predictions only

Length 733 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CTF3Q12748 YGR054WYGR054W 1929 nt6.78□□□□□ -1.32
CTF3Q12748 PRE3YJL001W 648 nt6.78□□□□□ -1.32
CTF3Q12748 VPS24YKL041W 675 nt6.78□□□□□ -1.32
CTF3Q12748 YLR157W-EYLR157W-E 165 nt6.78□□□□□ -1.32
CTF3Q12748 YNL097W-AYNL097W-A 156 nt6.78□□□□□ -1.32
CTF3Q12748 DFR1YOR236W 636 nt6.78□□□□□ -1.32
CTF3Q12748 RFS1YBR052C 633 nt6.78□□□□□ -1.32
CTF3Q12748 OPI11YPR044C 354 nt6.78□□□□□ -1.32
CTF3Q12748 PTC4YBR125C 1182 nt6.78□□□□□ -1.32
CTF3Q12748 MIP1YOR330C 3765 nt6.78□□□□□ -1.32
CTF3Q12748 YEN1YER041W 2280 nt6.78□□□□□ -1.32
CTF3Q12748 CCT3YJL014W 1605 nt6.77□□□□□ -1.33
CTF3Q12748 HVG1YER039C 750 nt6.77□□□□□ -1.33
CTF3Q12748 KSH1YNL024C-A 219 nt6.77□□□□□ -1.33
CTF3Q12748 COQ3YOL096C 939 nt6.77□□□□□ -1.33
CTF3Q12748 YBR226CYBR226C 411 nt6.77□□□□□ -1.33
CTF3Q12748 EDE1YBL047C 4146 nt6.77□□□□□ -1.33
CTF3Q12748 YHL018WYHL018W 363 nt6.76□□□□□ -1.33
CTF3Q12748 MIA40YKL195W 1212 nt6.76□□□□□ -1.33
CTF3Q12748 GTO3YMR251W 1101 nt6.76□□□□□ -1.33
CTF3Q12748 YPL250W-AYPL250W-A 288 nt6.76□□□□□ -1.33
CTF3Q12748 PAC10YGR078C 600 nt6.75□□□□□ -1.33
CTF3Q12748 TAH11YJR046W 1815 nt6.75□□□□□ -1.33
CTF3Q12748 CMK2YOL016C 1344 nt6.75□□□□□ -1.33
CTF3Q12748 SDH4YDR178W 546 nt6.74□□□□□ -1.33
CTF3Q12748 SNU71YGR013W 1863 nt6.74□□□□□ -1.33
CTF3Q12748 ERG1YGR175C 1491 nt6.73□□□□□ -1.33
CTF3Q12748 YGR139WYGR139W 339 nt6.73□□□□□ -1.33
CTF3Q12748 MDE1YJR024C 735 nt6.73□□□□□ -1.33
CTF3Q12748 PSR2YLR019W 1194 nt6.73□□□□□ -1.33
CTF3Q12748 GLC8YMR311C 690 nt6.73□□□□□ -1.33
CTF3Q12748 YTH1YPR107C 627 nt6.73□□□□□ -1.33
CTF3Q12748 ADH5YBR145W 1056 nt6.73□□□□□ -1.33
CTF3Q12748 RVB2YPL235W 1416 nt6.73□□□□□ -1.33
CTF3Q12748 HXT13YEL069C 1695 nt6.72□□□□□ -1.33
CTF3Q12748 CDC16YKL022C 2523 nt6.72□□□□□ -1.33
CTF3Q12748 HEM2YGL040C 1029 nt6.72□□□□□ -1.33
CTF3Q12748 GCN3YKR026C 918 nt6.72□□□□□ -1.33
CTF3Q12748 FPR3YML074C 1236 nt6.72□□□□□ -1.33
CTF3Q12748 YNL120CYNL120C 486 nt6.72□□□□□ -1.33
CTF3Q12748 RPS28AYOR167C 204 nt6.72□□□□□ -1.33
CTF3Q12748 CYB2YML054C 1776 nt6.72□□□□□ -1.33
CTF3Q12748 HHY1YEL059W 309 nt6.71□□□□□ -1.34
CTF3Q12748 ZRT2YLR130C 1269 nt6.71□□□□□ -1.34
CTF3Q12748 YNL017CYNL017C 339 nt6.71□□□□□ -1.34
CTF3Q12748 YNR014WYNR014W 639 nt6.71□□□□□ -1.34
CTF3Q12748 LDB16YCL005W 771 nt6.71□□□□□ -1.34
CTF3Q12748 HEM1YDR232W 1647 nt6.71□□□□□ -1.34
CTF3Q12748 PPT1YGR123C 1542 nt6.71□□□□□ -1.34
CTF3Q12748 GPH1YPR160W 2709 nt6.7□□□□□ -1.34
CTF3Q12748 RAD59YDL059C 717 nt6.7□□□□□ -1.34
CTF3Q12748 YPT1YFL038C 621 nt6.7□□□□□ -1.34
CTF3Q12748 AAT2YLR027C 1257 nt6.7□□□□□ -1.34
CTF3Q12748 TOS6YNL300W 309 nt6.7□□□□□ -1.34
CTF3Q12748 TSR3YOR006C 942 nt6.7□□□□□ -1.34
CTF3Q12748 PEX31YGR004W 1389 nt6.69□□□□□ -1.34
CTF3Q12748 PRY3YJL078C 2646 nt6.69□□□□□ -1.34
CTF3Q12748 GSH1YJL101C 2037 nt6.69□□□□□ -1.34
CTF3Q12748 YDR415CYDR415C 1125 nt6.69□□□□□ -1.34
CTF3Q12748 COX16YJL003W 357 nt6.69□□□□□ -1.34
CTF3Q12748 MOG1YJR074W 657 nt6.69□□□□□ -1.34
CTF3Q12748 YJR084WYJR084W 1272 nt6.69□□□□□ -1.34
CTF3Q12748 ECM31YBR176W 939 nt6.69□□□□□ -1.34
CTF3Q12748 NTG1YAL015C 1200 nt6.68□□□□□ -1.34
CTF3Q12748 YDL085C-AYDL085C-A 207 nt6.67□□□□□ -1.34
CTF3Q12748 ATP4YPL078C 735 nt6.67□□□□□ -1.34
CTF3Q12748 LYS21YDL131W 1323 nt6.67□□□□□ -1.34
CTF3Q12748 GPA1YHR005C 1419 nt6.67□□□□□ -1.34
CTF3Q12748 GDA1YEL042W 1557 nt6.66□□□□□ -1.34
CTF3Q12748 TIM22YDL217C 624 nt6.66□□□□□ -1.34
CTF3Q12748 YHR213W-AYHR213W-A 234 nt6.66□□□□□ -1.34
CTF3Q12748 MEH1YKR007W 555 nt6.66□□□□□ -1.34
CTF3Q12748 PUS5YLR165C 765 nt6.66□□□□□ -1.34
CTF3Q12748 CRF1YDR223W 1404 nt6.66□□□□□ -1.34
CTF3Q12748 MSY1YPL097W 1479 nt6.66□□□□□ -1.34
CTF3Q12748 PPS1YBR276C 2424 nt6.65□□□□□ -1.34
CTF3Q12748 DYS1YHR068W 1164 nt6.65□□□□□ -1.34
CTF3Q12748 YJR107WYJR107W 987 nt6.65□□□□□ -1.34
CTF3Q12748 FBA1YKL060C 1080 nt6.65□□□□□ -1.34
CTF3Q12748 IVY1YDR229W 1362 nt6.65□□□□□ -1.35
CTF3Q12748 YGR068W-AYGR068W-A 96 nt6.64□□□□□ -1.35
CTF3Q12748 RRP46YGR095C 672 nt6.64□□□□□ -1.35
CTF3Q12748 RPL5YPL131W 894 nt6.64□□□□□ -1.35
CTF3Q12748 UIP4YPL186C 915 nt6.64□□□□□ -1.35
CTF3Q12748 HEL1YKR017C 1656 nt6.64□□□□□ -1.35
CTF3Q12748 MSB3YNL293W 1902 nt6.64□□□□□ -1.35
CTF3Q12748 POX1YGL205W 2247 nt6.64□□□□□ -1.35
CTF3Q12748 CDC13YDL220C 2775 nt6.63□□□□□ -1.35
CTF3Q12748 DOT5YIL010W 648 nt6.63□□□□□ -1.35
CTF3Q12748 YKR032WYKR032W 315 nt6.63□□□□□ -1.35
CTF3Q12748 YOR200WYOR200W 399 nt6.63□□□□□ -1.35
CTF3Q12748 THI2YBR240C 1353 nt6.63□□□□□ -1.35
CTF3Q12748 CCR4YAL021C 2514 nt6.62□□□□□ -1.35
CTF3Q12748 YLL066CYLL066C 3618 nt6.62□□□□□ -1.35
CTF3Q12748 YLL067CYLL067C 3618 nt6.62□□□□□ -1.35
CTF3Q12748 BUD9YGR041W 1644 nt6.62□□□□□ -1.35
CTF3Q12748 BUG1YDL099W 1026 nt6.62□□□□□ -1.35
CTF3Q12748 FHN1YGR131W 525 nt6.62□□□□□ -1.35
CTF3Q12748 HGH1YGR187C 1185 nt6.62□□□□□ -1.35
CTF3Q12748 SQT1YIR012W 1296 nt6.62□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.4 ms