Protein–RNA interactions for Protein: Q12391

TY1A-NL1, Transposon Ty1-NL1 Gag polyprotein, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-NL1Q12391 ERP2YAL007C 648 nt6.94□□□□□ -1.3
TY1A-NL1Q12391 SNA3YJL151C 402 nt6.94□□□□□ -1.3
TY1A-NL1Q12391 YOL162WYOL162W 648 nt6.94□□□□□ -1.3
TY1A-NL1Q12391 GCD11YER025W 1584 nt6.94□□□□□ -1.3
TY1A-NL1Q12391 PRP46YPL151C 1356 nt6.94□□□□□ -1.3
TY1A-NL1Q12391 HFI1YPL254W 1467 nt6.93□□□□□ -1.3
TY1A-NL1Q12391 LUC7YDL087C 786 nt6.93□□□□□ -1.3
TY1A-NL1Q12391 NBP2YDR162C 711 nt6.93□□□□□ -1.3
TY1A-NL1Q12391 ERG20YJL167W 1059 nt6.93□□□□□ -1.3
TY1A-NL1Q12391 SPC42YKL042W 1092 nt6.93□□□□□ -1.3
TY1A-NL1Q12391 YKL091CYKL091C 933 nt6.93□□□□□ -1.3
TY1A-NL1Q12391 YBR232CYBR232C 360 nt6.93□□□□□ -1.3
TY1A-NL1Q12391 GNP1YDR508C 1992 nt6.93□□□□□ -1.3
TY1A-NL1Q12391 PPT1YGR123C 1542 nt6.92□□□□□ -1.3
TY1A-NL1Q12391 PCL2YDL127W 927 nt6.92□□□□□ -1.3
TY1A-NL1Q12391 YFR045WYFR045W 930 nt6.92□□□□□ -1.3
TY1A-NL1Q12391 HAM1YJR069C 594 nt6.92□□□□□ -1.3
TY1A-NL1Q12391 YML101C-AYML101C-A 318 nt6.92□□□□□ -1.3
TY1A-NL1Q12391 RCF2YNR018W 675 nt6.92□□□□□ -1.3
TY1A-NL1Q12391 YOR062CYOR062C 807 nt6.92□□□□□ -1.3
TY1A-NL1Q12391 YPL136WYPL136W 369 nt6.92□□□□□ -1.3
TY1A-NL1Q12391 AOS1YPR180W 1044 nt6.92□□□□□ -1.3
TY1A-NL1Q12391 YBR134WYBR134W 402 nt6.92□□□□□ -1.3
TY1A-NL1Q12391 LEO1YOR123C 1395 nt6.92□□□□□ -1.3
TY1A-NL1Q12391 NFI1YOR156C 2181 nt6.91□□□□□ -1.3
TY1A-NL1Q12391 IMG2YCR071C 441 nt6.91□□□□□ -1.3
TY1A-NL1Q12391 GRX6YDL010W 696 nt6.91□□□□□ -1.3
TY1A-NL1Q12391 YPT31YER031C 672 nt6.91□□□□□ -1.3
TY1A-NL1Q12391 GNA1YFL017C 480 nt6.91□□□□□ -1.3
TY1A-NL1Q12391 YUH1YJR099W 711 nt6.91□□□□□ -1.3
TY1A-NL1Q12391 YLL017WYLL017W 312 nt6.91□□□□□ -1.3
TY1A-NL1Q12391 YML094C-AYML094C-A 402 nt6.91□□□□□ -1.3
TY1A-NL1Q12391 COG5YNL051W 1212 nt6.91□□□□□ -1.3
TY1A-NL1Q12391 PRE10YOR362C 867 nt6.91□□□□□ -1.3
TY1A-NL1Q12391 SCP1YOR367W 603 nt6.91□□□□□ -1.3
TY1A-NL1Q12391 CBP6YBR120C 489 nt6.91□□□□□ -1.3
TY1A-NL1Q12391 MAL31YBR298C 1845 nt6.91□□□□□ -1.3
TY1A-NL1Q12391 ERG24YNL280C 1317 nt6.91□□□□□ -1.3
TY1A-NL1Q12391 TIM50YPL063W 1431 nt6.91□□□□□ -1.3
TY1A-NL1Q12391 ARH1YDR376W 1482 nt6.91□□□□□ -1.3
TY1A-NL1Q12391 MIF2YKL089W 1650 nt6.9□□□□□ -1.3
TY1A-NL1Q12391 YBL113CYBL113C 2379 nt6.9□□□□□ -1.3
TY1A-NL1Q12391 YER152W-AYER152W-A 567 nt6.9□□□□□ -1.3
TY1A-NL1Q12391 YFR057WYFR057W 456 nt6.9□□□□□ -1.3
TY1A-NL1Q12391 SER2YGR208W 930 nt6.9□□□□□ -1.3
TY1A-NL1Q12391 MRPL6YHR147C 645 nt6.9□□□□□ -1.3
TY1A-NL1Q12391 YLR162WYLR162W 357 nt6.9□□□□□ -1.3
TY1A-NL1Q12391 MRPL15YLR312W-A 762 nt6.9□□□□□ -1.3
TY1A-NL1Q12391 IFA38YBR159W 1044 nt6.9□□□□□ -1.3
TY1A-NL1Q12391 YKR018CYKR018C 2178 nt6.9□□□□□ -1.3
TY1A-NL1Q12391 SAM50YNL026W 1455 nt6.9□□□□□ -1.31
TY1A-NL1Q12391 ENP1YBR247C 1452 nt6.9□□□□□ -1.31
TY1A-NL1Q12391 ELP3YPL086C 1674 nt6.9□□□□□ -1.31
TY1A-NL1Q12391 GGC1YDL198C 903 nt6.89□□□□□ -1.31
TY1A-NL1Q12391 YDR034W-BYDR034W-B 156 nt6.89□□□□□ -1.31
TY1A-NL1Q12391 BI2Q0110 1272 nt6.89□□□□□ -1.31
TY1A-NL1Q12391 ADK2YER170W 678 nt6.89□□□□□ -1.31
TY1A-NL1Q12391 KSS1YGR040W 1107 nt6.89□□□□□ -1.31
TY1A-NL1Q12391 YLF2YHL014C 1218 nt6.89□□□□□ -1.31
TY1A-NL1Q12391 YHR112CYHR112C 1137 nt6.89□□□□□ -1.31
TY1A-NL1Q12391 RRT14YIL127C 621 nt6.89□□□□□ -1.31
TY1A-NL1Q12391 TIF2YJL138C 1188 nt6.89□□□□□ -1.31
TY1A-NL1Q12391 CBT1YKL208W 816 nt6.89□□□□□ -1.31
TY1A-NL1Q12391 TIF1YKR059W 1188 nt6.89□□□□□ -1.31
TY1A-NL1Q12391 YLL059CYLL059C 507 nt6.89□□□□□ -1.31
TY1A-NL1Q12391 PSY3YLR376C 729 nt6.89□□□□□ -1.31
TY1A-NL1Q12391 RPN8YOR261C 1017 nt6.89□□□□□ -1.31
TY1A-NL1Q12391 LSP1YPL004C 1026 nt6.89□□□□□ -1.31
TY1A-NL1Q12391 VHS2YIL135C 1311 nt6.89□□□□□ -1.31
TY1A-NL1Q12391 TEP1YNL128W 1305 nt6.89□□□□□ -1.31
TY1A-NL1Q12391 DRN1YGR093W 1524 nt6.89□□□□□ -1.31
TY1A-NL1Q12391 AQR1YNL065W 1761 nt6.88□□□□□ -1.31
TY1A-NL1Q12391 POB3YML069W 1659 nt6.88□□□□□ -1.31
TY1A-NL1Q12391 YDR124WYDR124W 975 nt6.88□□□□□ -1.31
TY1A-NL1Q12391 YEA6YEL006W 1008 nt6.88□□□□□ -1.31
TY1A-NL1Q12391 DST1YGL043W 930 nt6.88□□□□□ -1.31
TY1A-NL1Q12391 YGR210CYGR210C 1236 nt6.88□□□□□ -1.31
TY1A-NL1Q12391 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt6.88□□□□□ -1.31
TY1A-NL1Q12391 YLR307C-AYLR307C-A 264 nt6.88□□□□□ -1.31
TY1A-NL1Q12391 YMR144WYMR144W 1029 nt6.88□□□□□ -1.31
TY1A-NL1Q12391 RFA2YNL312W 822 nt6.88□□□□□ -1.31
TY1A-NL1Q12391 YOL166CYOL166C 339 nt6.88□□□□□ -1.31
TY1A-NL1Q12391 YOR041CYOR041C 432 nt6.88□□□□□ -1.31
TY1A-NL1Q12391 ECM10YEL030W 1935 nt6.88□□□□□ -1.31
TY1A-NL1Q12391 HTS1YPR033C 1641 nt6.87□□□□□ -1.31
TY1A-NL1Q12391 YDR132CYDR132C 1488 nt6.87□□□□□ -1.31
TY1A-NL1Q12391 TGA1tA(UGC)A 73 nt6.87□□□□□ -1.31
TY1A-NL1Q12391 tA(UGC)EtA(UGC)E 73 nt6.87□□□□□ -1.31
TY1A-NL1Q12391 tA(UGC)GtA(UGC)G 73 nt6.87□□□□□ -1.31
TY1A-NL1Q12391 tA(UGC)LtA(UGC)L 73 nt6.87□□□□□ -1.31
TY1A-NL1Q12391 tA(UGC)OtA(UGC)O 73 nt6.87□□□□□ -1.31
TY1A-NL1Q12391 YAP6YDR259C 1152 nt6.87□□□□□ -1.31
TY1A-NL1Q12391 HPM1YIL110W 1134 nt6.87□□□□□ -1.31
TY1A-NL1Q12391 VPS65YLR322W 315 nt6.87□□□□□ -1.31
TY1A-NL1Q12391 YNL134CYNL134C 1131 nt6.87□□□□□ -1.31
TY1A-NL1Q12391 MNN9YPL050C 1188 nt6.87□□□□□ -1.31
TY1A-NL1Q12391 YPL108WYPL108W 507 nt6.87□□□□□ -1.31
TY1A-NL1Q12391 YPR084WYPR084W 1371 nt6.86□□□□□ -1.31
TY1A-NL1Q12391 FRT1YOR324C 1809 nt6.86□□□□□ -1.31
TY1A-NL1Q12391 HIM1YDR317W 1245 nt6.86□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14.4 ms