Protein–RNA interactions for Protein: Q10472

GALNT1, Polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALNT1Q10472 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GALNT1Q10472 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GALNT1Q10472 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GALNT1Q10472 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GALNT1Q10472 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
GALNT1Q10472 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GALNT1Q10472 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GALNT1Q10472 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GALNT1Q10472 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GALNT1Q10472 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GALNT1Q10472 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GALNT1Q10472 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GALNT1Q10472 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GALNT1Q10472 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GALNT1Q10472 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GALNT1Q10472 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GALNT1Q10472 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
GALNT1Q10472 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GALNT1Q10472 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GALNT1Q10472 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GALNT1Q10472 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
GALNT1Q10472 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GALNT1Q10472 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GALNT1Q10472 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GALNT1Q10472 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GALNT1Q10472 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
GALNT1Q10472 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GALNT1Q10472 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GALNT1Q10472 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GALNT1Q10472 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GALNT1Q10472 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GALNT1Q10472 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GALNT1Q10472 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GALNT1Q10472 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
GALNT1Q10472 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GALNT1Q10472 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GALNT1Q10472 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GALNT1Q10472 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GALNT1Q10472 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
GALNT1Q10472 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GALNT1Q10472 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GALNT1Q10472 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GALNT1Q10472 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GALNT1Q10472 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GALNT1Q10472 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GALNT1Q10472 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GALNT1Q10472 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GALNT1Q10472 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GALNT1Q10472 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GALNT1Q10472 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GALNT1Q10472 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GALNT1Q10472 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GALNT1Q10472 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GALNT1Q10472 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GALNT1Q10472 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GALNT1Q10472 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GALNT1Q10472 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GALNT1Q10472 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GALNT1Q10472 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GALNT1Q10472 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GALNT1Q10472 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GALNT1Q10472 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GALNT1Q10472 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
GALNT1Q10472 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GALNT1Q10472 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GALNT1Q10472 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GALNT1Q10472 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GALNT1Q10472 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GALNT1Q10472 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GALNT1Q10472 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GALNT1Q10472 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
GALNT1Q10472 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
GALNT1Q10472 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GALNT1Q10472 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
GALNT1Q10472 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GALNT1Q10472 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GALNT1Q10472 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GALNT1Q10472 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GALNT1Q10472 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GALNT1Q10472 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GALNT1Q10472 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GALNT1Q10472 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GALNT1Q10472 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GALNT1Q10472 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GALNT1Q10472 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GALNT1Q10472 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GALNT1Q10472 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GALNT1Q10472 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GALNT1Q10472 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GALNT1Q10472 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GALNT1Q10472 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GALNT1Q10472 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GALNT1Q10472 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GALNT1Q10472 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GALNT1Q10472 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
GALNT1Q10472 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GALNT1Q10472 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GALNT1Q10472 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GALNT1Q10472 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GALNT1Q10472 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms