Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RIPPLY1Q0D2K3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RIPPLY1Q0D2K3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RIPPLY1Q0D2K3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RIPPLY1Q0D2K3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
RIPPLY1Q0D2K3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RIPPLY1Q0D2K3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RIPPLY1Q0D2K3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RIPPLY1Q0D2K3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
RIPPLY1Q0D2K3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RIPPLY1Q0D2K3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RIPPLY1Q0D2K3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RIPPLY1Q0D2K3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RIPPLY1Q0D2K3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RIPPLY1Q0D2K3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RIPPLY1Q0D2K3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RIPPLY1Q0D2K3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RIPPLY1Q0D2K3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RIPPLY1Q0D2K3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
RIPPLY1Q0D2K3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RIPPLY1Q0D2K3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
RIPPLY1Q0D2K3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RIPPLY1Q0D2K3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RIPPLY1Q0D2K3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RIPPLY1Q0D2K3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RIPPLY1Q0D2K3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RIPPLY1Q0D2K3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RIPPLY1Q0D2K3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RIPPLY1Q0D2K3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RIPPLY1Q0D2K3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RIPPLY1Q0D2K3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RIPPLY1Q0D2K3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RIPPLY1Q0D2K3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RIPPLY1Q0D2K3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RIPPLY1Q0D2K3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RIPPLY1Q0D2K3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RIPPLY1Q0D2K3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RIPPLY1Q0D2K3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
RIPPLY1Q0D2K3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RIPPLY1Q0D2K3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RIPPLY1Q0D2K3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RIPPLY1Q0D2K3 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RIPPLY1Q0D2K3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RIPPLY1Q0D2K3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
RIPPLY1Q0D2K3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RIPPLY1Q0D2K3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RIPPLY1Q0D2K3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RIPPLY1Q0D2K3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
RIPPLY1Q0D2K3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RIPPLY1Q0D2K3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RIPPLY1Q0D2K3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RIPPLY1Q0D2K3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RIPPLY1Q0D2K3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RIPPLY1Q0D2K3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RIPPLY1Q0D2K3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RIPPLY1Q0D2K3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RIPPLY1Q0D2K3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RIPPLY1Q0D2K3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RIPPLY1Q0D2K3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RIPPLY1Q0D2K3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RIPPLY1Q0D2K3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RIPPLY1Q0D2K3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RIPPLY1Q0D2K3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RIPPLY1Q0D2K3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RIPPLY1Q0D2K3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RIPPLY1Q0D2K3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RIPPLY1Q0D2K3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RIPPLY1Q0D2K3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RIPPLY1Q0D2K3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RIPPLY1Q0D2K3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RIPPLY1Q0D2K3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
RIPPLY1Q0D2K3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RIPPLY1Q0D2K3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RIPPLY1Q0D2K3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RIPPLY1Q0D2K3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RIPPLY1Q0D2K3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RIPPLY1Q0D2K3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RIPPLY1Q0D2K3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RIPPLY1Q0D2K3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RIPPLY1Q0D2K3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RIPPLY1Q0D2K3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RIPPLY1Q0D2K3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RIPPLY1Q0D2K3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
RIPPLY1Q0D2K3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RIPPLY1Q0D2K3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RIPPLY1Q0D2K3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RIPPLY1Q0D2K3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RIPPLY1Q0D2K3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RIPPLY1Q0D2K3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RIPPLY1Q0D2K3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
RIPPLY1Q0D2K3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RIPPLY1Q0D2K3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RIPPLY1Q0D2K3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RIPPLY1Q0D2K3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
RIPPLY1Q0D2K3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RIPPLY1Q0D2K3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RIPPLY1Q0D2K3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RIPPLY1Q0D2K3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RIPPLY1Q0D2K3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.7 ms