Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRP1Q07954 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRP1Q07954 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRP1Q07954 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
LRP1Q07954 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
LRP1Q07954 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
LRP1Q07954 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
LRP1Q07954 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRP1Q07954 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRP1Q07954 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
LRP1Q07954 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRP1Q07954 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRP1Q07954 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRP1Q07954 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRP1Q07954 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRP1Q07954 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRP1Q07954 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRP1Q07954 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRP1Q07954 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRP1Q07954 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRP1Q07954 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LRP1Q07954 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LRP1Q07954 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
LRP1Q07954 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LRP1Q07954 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LRP1Q07954 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LRP1Q07954 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LRP1Q07954 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LRP1Q07954 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
LRP1Q07954 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LRP1Q07954 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LRP1Q07954 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LRP1Q07954 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LRP1Q07954 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LRP1Q07954 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LRP1Q07954 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LRP1Q07954 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LRP1Q07954 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LRP1Q07954 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
LRP1Q07954 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LRP1Q07954 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LRP1Q07954 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LRP1Q07954 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LRP1Q07954 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LRP1Q07954 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LRP1Q07954 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LRP1Q07954 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LRP1Q07954 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LRP1Q07954 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LRP1Q07954 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LRP1Q07954 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LRP1Q07954 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LRP1Q07954 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LRP1Q07954 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LRP1Q07954 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRP1Q07954 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRP1Q07954 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRP1Q07954 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRP1Q07954 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRP1Q07954 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRP1Q07954 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRP1Q07954 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LRP1Q07954 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRP1Q07954 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRP1Q07954 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRP1Q07954 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRP1Q07954 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRP1Q07954 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LRP1Q07954 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LRP1Q07954 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRP1Q07954 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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LRP1Q07954 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRP1Q07954 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LRP1Q07954 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LRP1Q07954 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
LRP1Q07954 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LRP1Q07954 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LRP1Q07954 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LRP1Q07954 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LRP1Q07954 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LRP1Q07954 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LRP1Q07954 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
LRP1Q07954 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LRP1Q07954 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LRP1Q07954 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LRP1Q07954 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LRP1Q07954 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
LRP1Q07954 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRP1Q07954 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRP1Q07954 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRP1Q07954 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRP1Q07954 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
LRP1Q07954 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRP1Q07954 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LRP1Q07954 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
LRP1Q07954 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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