Protein–RNA interactions for Protein: Q07343

PDE4B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4BQ07343 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PDE4BQ07343 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PDE4BQ07343 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PDE4BQ07343 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PDE4BQ07343 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PDE4BQ07343 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PDE4BQ07343 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PDE4BQ07343 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PDE4BQ07343 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
PDE4BQ07343 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PDE4BQ07343 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PDE4BQ07343 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
PDE4BQ07343 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PDE4BQ07343 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PDE4BQ07343 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PDE4BQ07343 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PDE4BQ07343 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PDE4BQ07343 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PDE4BQ07343 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PDE4BQ07343 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PDE4BQ07343 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PDE4BQ07343 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PDE4BQ07343 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PDE4BQ07343 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PDE4BQ07343 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PDE4BQ07343 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PDE4BQ07343 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PDE4BQ07343 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PDE4BQ07343 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PDE4BQ07343 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PDE4BQ07343 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PDE4BQ07343 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PDE4BQ07343 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
PDE4BQ07343 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PDE4BQ07343 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
PDE4BQ07343 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PDE4BQ07343 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
PDE4BQ07343 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PDE4BQ07343 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PDE4BQ07343 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
PDE4BQ07343 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PDE4BQ07343 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PDE4BQ07343 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PDE4BQ07343 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
PDE4BQ07343 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PDE4BQ07343 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PDE4BQ07343 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PDE4BQ07343 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PDE4BQ07343 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PDE4BQ07343 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PDE4BQ07343 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PDE4BQ07343 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PDE4BQ07343 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PDE4BQ07343 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PDE4BQ07343 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PDE4BQ07343 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PDE4BQ07343 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PDE4BQ07343 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PDE4BQ07343 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PDE4BQ07343 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PDE4BQ07343 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PDE4BQ07343 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PDE4BQ07343 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PDE4BQ07343 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PDE4BQ07343 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PDE4BQ07343 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PDE4BQ07343 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PDE4BQ07343 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
PDE4BQ07343 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PDE4BQ07343 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PDE4BQ07343 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PDE4BQ07343 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PDE4BQ07343 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PDE4BQ07343 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
PDE4BQ07343 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
PDE4BQ07343 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PDE4BQ07343 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PDE4BQ07343 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PDE4BQ07343 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PDE4BQ07343 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PDE4BQ07343 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PDE4BQ07343 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PDE4BQ07343 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
PDE4BQ07343 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PDE4BQ07343 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PDE4BQ07343 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PDE4BQ07343 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PDE4BQ07343 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PDE4BQ07343 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PDE4BQ07343 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PDE4BQ07343 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PDE4BQ07343 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
PDE4BQ07343 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
PDE4BQ07343 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PDE4BQ07343 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PDE4BQ07343 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PDE4BQ07343 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PDE4BQ07343 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PDE4BQ07343 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PDE4BQ07343 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms