Protein–RNA interactions for Protein: Q02446

SP4, Transcription factor Sp4, humanhuman

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP4Q02446 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
SP4Q02446 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SP4Q02446 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SP4Q02446 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SP4Q02446 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
SP4Q02446 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SP4Q02446 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SP4Q02446 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SP4Q02446 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
SP4Q02446 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SP4Q02446 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SP4Q02446 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SP4Q02446 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SP4Q02446 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SP4Q02446 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
SP4Q02446 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SP4Q02446 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
SP4Q02446 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
SP4Q02446 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SP4Q02446 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SP4Q02446 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SP4Q02446 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SP4Q02446 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
SP4Q02446 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SP4Q02446 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SP4Q02446 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SP4Q02446 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SP4Q02446 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SP4Q02446 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SP4Q02446 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SP4Q02446 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SP4Q02446 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SP4Q02446 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SP4Q02446 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SP4Q02446 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
SP4Q02446 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SP4Q02446 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SP4Q02446 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SP4Q02446 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SP4Q02446 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SP4Q02446 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SP4Q02446 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SP4Q02446 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SP4Q02446 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SP4Q02446 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SP4Q02446 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SP4Q02446 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SP4Q02446 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SP4Q02446 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SP4Q02446 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SP4Q02446 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SP4Q02446 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SP4Q02446 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SP4Q02446 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SP4Q02446 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
SP4Q02446 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SP4Q02446 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SP4Q02446 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SP4Q02446 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SP4Q02446 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SP4Q02446 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
SP4Q02446 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SP4Q02446 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SP4Q02446 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SP4Q02446 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SP4Q02446 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SP4Q02446 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SP4Q02446 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SP4Q02446 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SP4Q02446 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SP4Q02446 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SP4Q02446 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SP4Q02446 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SP4Q02446 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SP4Q02446 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SP4Q02446 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SP4Q02446 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SP4Q02446 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SP4Q02446 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SP4Q02446 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
SP4Q02446 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SP4Q02446 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SP4Q02446 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SP4Q02446 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SP4Q02446 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SP4Q02446 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SP4Q02446 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SP4Q02446 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SP4Q02446 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SP4Q02446 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SP4Q02446 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SP4Q02446 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SP4Q02446 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SP4Q02446 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SP4Q02446 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SP4Q02446 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SP4Q02446 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SP4Q02446 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SP4Q02446 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SP4Q02446 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms