Protein–RNA interactions for Protein: Q01196

RUNX1, Runt-related transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX1Q01196 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RUNX1Q01196 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RUNX1Q01196 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RUNX1Q01196 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RUNX1Q01196 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RUNX1Q01196 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RUNX1Q01196 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RUNX1Q01196 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RUNX1Q01196 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RUNX1Q01196 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RUNX1Q01196 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RUNX1Q01196 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RUNX1Q01196 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RUNX1Q01196 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
RUNX1Q01196 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RUNX1Q01196 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RUNX1Q01196 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RUNX1Q01196 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RUNX1Q01196 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RUNX1Q01196 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RUNX1Q01196 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RUNX1Q01196 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RUNX1Q01196 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RUNX1Q01196 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RUNX1Q01196 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RUNX1Q01196 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RUNX1Q01196 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RUNX1Q01196 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RUNX1Q01196 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC19.77■□□□□ 0.75
RUNX1Q01196 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RUNX1Q01196 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RUNX1Q01196 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RUNX1Q01196 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
RUNX1Q01196 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RUNX1Q01196 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RUNX1Q01196 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RUNX1Q01196 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RUNX1Q01196 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RUNX1Q01196 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RUNX1Q01196 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RUNX1Q01196 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RUNX1Q01196 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RUNX1Q01196 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RUNX1Q01196 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RUNX1Q01196 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RUNX1Q01196 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RUNX1Q01196 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RUNX1Q01196 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RUNX1Q01196 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RUNX1Q01196 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RUNX1Q01196 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RUNX1Q01196 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RUNX1Q01196 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
RUNX1Q01196 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RUNX1Q01196 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RUNX1Q01196 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RUNX1Q01196 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RUNX1Q01196 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RUNX1Q01196 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RUNX1Q01196 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RUNX1Q01196 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RUNX1Q01196 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RUNX1Q01196 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RUNX1Q01196 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RUNX1Q01196 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RUNX1Q01196 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RUNX1Q01196 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RUNX1Q01196 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RUNX1Q01196 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RUNX1Q01196 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RUNX1Q01196 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RUNX1Q01196 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RUNX1Q01196 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RUNX1Q01196 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RUNX1Q01196 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
RUNX1Q01196 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RUNX1Q01196 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RUNX1Q01196 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RUNX1Q01196 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RUNX1Q01196 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RUNX1Q01196 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RUNX1Q01196 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RUNX1Q01196 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RUNX1Q01196 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RUNX1Q01196 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RUNX1Q01196 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RUNX1Q01196 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RUNX1Q01196 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RUNX1Q01196 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RUNX1Q01196 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RUNX1Q01196 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RUNX1Q01196 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RUNX1Q01196 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RUNX1Q01196 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RUNX1Q01196 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RUNX1Q01196 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RUNX1Q01196 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RUNX1Q01196 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RUNX1Q01196 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RUNX1Q01196 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.5 ms