Protein–RNA interactions for Protein: Q00266

MAT1A, S-adenosylmethionine synthase isoform type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAT1AQ00266 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MAT1AQ00266 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MAT1AQ00266 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MAT1AQ00266 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MAT1AQ00266 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MAT1AQ00266 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MAT1AQ00266 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MAT1AQ00266 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
MAT1AQ00266 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MAT1AQ00266 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MAT1AQ00266 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MAT1AQ00266 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MAT1AQ00266 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MAT1AQ00266 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MAT1AQ00266 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MAT1AQ00266 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MAT1AQ00266 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MAT1AQ00266 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MAT1AQ00266 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MAT1AQ00266 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MAT1AQ00266 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MAT1AQ00266 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MAT1AQ00266 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MAT1AQ00266 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MAT1AQ00266 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MAT1AQ00266 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MAT1AQ00266 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MAT1AQ00266 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MAT1AQ00266 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MAT1AQ00266 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MAT1AQ00266 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MAT1AQ00266 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MAT1AQ00266 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MAT1AQ00266 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MAT1AQ00266 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MAT1AQ00266 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MAT1AQ00266 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
MAT1AQ00266 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MAT1AQ00266 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MAT1AQ00266 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MAT1AQ00266 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MAT1AQ00266 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
MAT1AQ00266 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MAT1AQ00266 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MAT1AQ00266 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
MAT1AQ00266 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MAT1AQ00266 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MAT1AQ00266 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MAT1AQ00266 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MAT1AQ00266 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MAT1AQ00266 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MAT1AQ00266 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MAT1AQ00266 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MAT1AQ00266 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
MAT1AQ00266 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MAT1AQ00266 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MAT1AQ00266 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MAT1AQ00266 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MAT1AQ00266 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MAT1AQ00266 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MAT1AQ00266 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MAT1AQ00266 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MAT1AQ00266 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MAT1AQ00266 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MAT1AQ00266 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
MAT1AQ00266 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
MAT1AQ00266 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MAT1AQ00266 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MAT1AQ00266 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MAT1AQ00266 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MAT1AQ00266 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
MAT1AQ00266 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MAT1AQ00266 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MAT1AQ00266 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MAT1AQ00266 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MAT1AQ00266 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MAT1AQ00266 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MAT1AQ00266 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MAT1AQ00266 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MAT1AQ00266 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MAT1AQ00266 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
MAT1AQ00266 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
MAT1AQ00266 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MAT1AQ00266 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MAT1AQ00266 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MAT1AQ00266 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
MAT1AQ00266 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MAT1AQ00266 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MAT1AQ00266 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MAT1AQ00266 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MAT1AQ00266 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MAT1AQ00266 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MAT1AQ00266 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MAT1AQ00266 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MAT1AQ00266 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
MAT1AQ00266 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MAT1AQ00266 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MAT1AQ00266 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MAT1AQ00266 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MAT1AQ00266 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms