Protein–RNA interactions for Protein: P84550

SKOR1, SKI family transcriptional corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR1P84550 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SKOR1P84550 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SKOR1P84550 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SKOR1P84550 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SKOR1P84550 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SKOR1P84550 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SKOR1P84550 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SKOR1P84550 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SKOR1P84550 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SKOR1P84550 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SKOR1P84550 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SKOR1P84550 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SKOR1P84550 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SKOR1P84550 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SKOR1P84550 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SKOR1P84550 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SKOR1P84550 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SKOR1P84550 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SKOR1P84550 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SKOR1P84550 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SKOR1P84550 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SKOR1P84550 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SKOR1P84550 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SKOR1P84550 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SKOR1P84550 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SKOR1P84550 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SKOR1P84550 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SKOR1P84550 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SKOR1P84550 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SKOR1P84550 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SKOR1P84550 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SKOR1P84550 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SKOR1P84550 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SKOR1P84550 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SKOR1P84550 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SKOR1P84550 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SKOR1P84550 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SKOR1P84550 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SKOR1P84550 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SKOR1P84550 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SKOR1P84550 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SKOR1P84550 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SKOR1P84550 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SKOR1P84550 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SKOR1P84550 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SKOR1P84550 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SKOR1P84550 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SKOR1P84550 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SKOR1P84550 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SKOR1P84550 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SKOR1P84550 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SKOR1P84550 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SKOR1P84550 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SKOR1P84550 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SKOR1P84550 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SKOR1P84550 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SKOR1P84550 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SKOR1P84550 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SKOR1P84550 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SKOR1P84550 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SKOR1P84550 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SKOR1P84550 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SKOR1P84550 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SKOR1P84550 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SKOR1P84550 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SKOR1P84550 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SKOR1P84550 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SKOR1P84550 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SKOR1P84550 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SKOR1P84550 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SKOR1P84550 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SKOR1P84550 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SKOR1P84550 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SKOR1P84550 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SKOR1P84550 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SKOR1P84550 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SKOR1P84550 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SKOR1P84550 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SKOR1P84550 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SKOR1P84550 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SKOR1P84550 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SKOR1P84550 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SKOR1P84550 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SKOR1P84550 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SKOR1P84550 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SKOR1P84550 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SKOR1P84550 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SKOR1P84550 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SKOR1P84550 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SKOR1P84550 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SKOR1P84550 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SKOR1P84550 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SKOR1P84550 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SKOR1P84550 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SKOR1P84550 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SKOR1P84550 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SKOR1P84550 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SKOR1P84550 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SKOR1P84550 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SKOR1P84550 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms