Protein–RNA interactions for Protein: P84074

HPCA, Neuron-specific calcium-binding protein hippocalcin, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPCAP84074 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HPCAP84074 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HPCAP84074 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HPCAP84074 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HPCAP84074 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HPCAP84074 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HPCAP84074 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HPCAP84074 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HPCAP84074 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HPCAP84074 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HPCAP84074 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HPCAP84074 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HPCAP84074 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HPCAP84074 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
HPCAP84074 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
HPCAP84074 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
HPCAP84074 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HPCAP84074 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HPCAP84074 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HPCAP84074 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HPCAP84074 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HPCAP84074 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HPCAP84074 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HPCAP84074 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HPCAP84074 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HPCAP84074 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HPCAP84074 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HPCAP84074 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
HPCAP84074 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HPCAP84074 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HPCAP84074 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
HPCAP84074 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HPCAP84074 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HPCAP84074 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HPCAP84074 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HPCAP84074 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
HPCAP84074 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HPCAP84074 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HPCAP84074 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HPCAP84074 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HPCAP84074 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HPCAP84074 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
HPCAP84074 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HPCAP84074 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HPCAP84074 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HPCAP84074 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HPCAP84074 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HPCAP84074 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HPCAP84074 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HPCAP84074 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HPCAP84074 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HPCAP84074 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HPCAP84074 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HPCAP84074 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HPCAP84074 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
HPCAP84074 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HPCAP84074 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HPCAP84074 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HPCAP84074 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HPCAP84074 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HPCAP84074 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HPCAP84074 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HPCAP84074 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HPCAP84074 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HPCAP84074 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HPCAP84074 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HPCAP84074 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HPCAP84074 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HPCAP84074 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HPCAP84074 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HPCAP84074 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HPCAP84074 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HPCAP84074 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HPCAP84074 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HPCAP84074 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HPCAP84074 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HPCAP84074 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HPCAP84074 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HPCAP84074 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HPCAP84074 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HPCAP84074 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HPCAP84074 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HPCAP84074 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HPCAP84074 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HPCAP84074 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HPCAP84074 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HPCAP84074 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HPCAP84074 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
HPCAP84074 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HPCAP84074 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HPCAP84074 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HPCAP84074 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HPCAP84074 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HPCAP84074 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HPCAP84074 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HPCAP84074 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HPCAP84074 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HPCAP84074 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HPCAP84074 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HPCAP84074 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.6 ms