Protein–RNA interactions for Protein: P63124

HERV-K104, Endogenous retrovirus group K member 104 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERV-K104P63124 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERV-K104P63124 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERV-K104P63124 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERV-K104P63124 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERV-K104P63124 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERV-K104P63124 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERV-K104P63124 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERV-K104P63124 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERV-K104P63124 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERV-K104P63124 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERV-K104P63124 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERV-K104P63124 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERV-K104P63124 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERV-K104P63124 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERV-K104P63124 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERV-K104P63124 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERV-K104P63124 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERV-K104P63124 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERV-K104P63124 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERV-K104P63124 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERV-K104P63124 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERV-K104P63124 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERV-K104P63124 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HERV-K104P63124 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERV-K104P63124 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERV-K104P63124 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERV-K104P63124 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERV-K104P63124 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERV-K104P63124 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERV-K104P63124 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERV-K104P63124 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERV-K104P63124 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERV-K104P63124 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERV-K104P63124 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERV-K104P63124 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERV-K104P63124 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERV-K104P63124 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HERV-K104P63124 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERV-K104P63124 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HERV-K104P63124 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERV-K104P63124 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERV-K104P63124 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERV-K104P63124 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERV-K104P63124 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERV-K104P63124 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERV-K104P63124 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERV-K104P63124 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERV-K104P63124 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERV-K104P63124 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERV-K104P63124 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERV-K104P63124 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERV-K104P63124 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERV-K104P63124 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERV-K104P63124 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERV-K104P63124 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERV-K104P63124 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERV-K104P63124 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERV-K104P63124 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERV-K104P63124 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERV-K104P63124 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERV-K104P63124 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERV-K104P63124 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERV-K104P63124 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERV-K104P63124 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERV-K104P63124 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERV-K104P63124 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERV-K104P63124 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERV-K104P63124 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERV-K104P63124 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERV-K104P63124 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERV-K104P63124 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERV-K104P63124 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERV-K104P63124 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERV-K104P63124 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERV-K104P63124 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERV-K104P63124 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERV-K104P63124 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERV-K104P63124 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERV-K104P63124 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERV-K104P63124 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERV-K104P63124 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERV-K104P63124 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERV-K104P63124 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HERV-K104P63124 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERV-K104P63124 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERV-K104P63124 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERV-K104P63124 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERV-K104P63124 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERV-K104P63124 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERV-K104P63124 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERV-K104P63124 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERV-K104P63124 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERV-K104P63124 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERV-K104P63124 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERV-K104P63124 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERV-K104P63124 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HERV-K104P63124 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HERV-K104P63124 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERV-K104P63124 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERV-K104P63124 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.4 ms