Protein–RNA interactions for Protein: P60900

PSMA6, Proteasome subunit alpha type-6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA6P60900 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMA6P60900 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMA6P60900 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMA6P60900 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMA6P60900 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMA6P60900 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMA6P60900 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMA6P60900 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMA6P60900 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSMA6P60900 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSMA6P60900 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSMA6P60900 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSMA6P60900 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSMA6P60900 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSMA6P60900 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSMA6P60900 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSMA6P60900 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSMA6P60900 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSMA6P60900 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSMA6P60900 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PSMA6P60900 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSMA6P60900 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMA6P60900 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMA6P60900 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMA6P60900 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMA6P60900 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMA6P60900 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMA6P60900 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMA6P60900 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMA6P60900 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMA6P60900 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMA6P60900 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMA6P60900 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMA6P60900 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMA6P60900 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMA6P60900 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMA6P60900 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMA6P60900 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMA6P60900 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMA6P60900 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMA6P60900 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMA6P60900 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PSMA6P60900 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSMA6P60900 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSMA6P60900 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSMA6P60900 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSMA6P60900 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSMA6P60900 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSMA6P60900 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMA6P60900 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMA6P60900 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMA6P60900 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMA6P60900 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMA6P60900 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMA6P60900 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMA6P60900 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMA6P60900 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMA6P60900 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMA6P60900 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSMA6P60900 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSMA6P60900 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSMA6P60900 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMA6P60900 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMA6P60900 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMA6P60900 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMA6P60900 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMA6P60900 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMA6P60900 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMA6P60900 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMA6P60900 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMA6P60900 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMA6P60900 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMA6P60900 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMA6P60900 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMA6P60900 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMA6P60900 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMA6P60900 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMA6P60900 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMA6P60900 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMA6P60900 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMA6P60900 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMA6P60900 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMA6P60900 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMA6P60900 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSMA6P60900 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSMA6P60900 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSMA6P60900 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PSMA6P60900 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PSMA6P60900 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PSMA6P60900 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PSMA6P60900 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PSMA6P60900 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
PSMA6P60900 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PSMA6P60900 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PSMA6P60900 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PSMA6P60900 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PSMA6P60900 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PSMA6P60900 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PSMA6P60900 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PSMA6P60900 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106 ms