Protein–RNA interactions for Protein: P60022

DEFB1, Beta-defensin 1, humanhuman

Predictions only

Length 68 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFB1P60022 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DEFB1P60022 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DEFB1P60022 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DEFB1P60022 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DEFB1P60022 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DEFB1P60022 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DEFB1P60022 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DEFB1P60022 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DEFB1P60022 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DEFB1P60022 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
DEFB1P60022 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DEFB1P60022 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DEFB1P60022 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DEFB1P60022 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
DEFB1P60022 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
DEFB1P60022 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
DEFB1P60022 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DEFB1P60022 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DEFB1P60022 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DEFB1P60022 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DEFB1P60022 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DEFB1P60022 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DEFB1P60022 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DEFB1P60022 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DEFB1P60022 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DEFB1P60022 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DEFB1P60022 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DEFB1P60022 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DEFB1P60022 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DEFB1P60022 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DEFB1P60022 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DEFB1P60022 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DEFB1P60022 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DEFB1P60022 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DEFB1P60022 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DEFB1P60022 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DEFB1P60022 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DEFB1P60022 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DEFB1P60022 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DEFB1P60022 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DEFB1P60022 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DEFB1P60022 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DEFB1P60022 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DEFB1P60022 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DEFB1P60022 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DEFB1P60022 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DEFB1P60022 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DEFB1P60022 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DEFB1P60022 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DEFB1P60022 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DEFB1P60022 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DEFB1P60022 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DEFB1P60022 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DEFB1P60022 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DEFB1P60022 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DEFB1P60022 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DEFB1P60022 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DEFB1P60022 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DEFB1P60022 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DEFB1P60022 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DEFB1P60022 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DEFB1P60022 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DEFB1P60022 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DEFB1P60022 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
DEFB1P60022 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DEFB1P60022 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DEFB1P60022 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DEFB1P60022 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DEFB1P60022 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DEFB1P60022 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DEFB1P60022 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DEFB1P60022 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DEFB1P60022 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DEFB1P60022 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DEFB1P60022 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DEFB1P60022 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DEFB1P60022 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DEFB1P60022 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DEFB1P60022 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DEFB1P60022 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DEFB1P60022 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DEFB1P60022 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
DEFB1P60022 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DEFB1P60022 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
DEFB1P60022 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
DEFB1P60022 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DEFB1P60022 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DEFB1P60022 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DEFB1P60022 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
DEFB1P60022 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DEFB1P60022 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DEFB1P60022 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DEFB1P60022 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DEFB1P60022 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DEFB1P60022 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DEFB1P60022 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DEFB1P60022 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DEFB1P60022 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DEFB1P60022 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DEFB1P60022 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms