Protein–RNA interactions for Protein: P59666

DEFA3, Neutrophil defensin 3, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA3P59666 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DEFA3P59666 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DEFA3P59666 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DEFA3P59666 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DEFA3P59666 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DEFA3P59666 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DEFA3P59666 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DEFA3P59666 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DEFA3P59666 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
DEFA3P59666 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DEFA3P59666 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DEFA3P59666 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DEFA3P59666 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DEFA3P59666 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DEFA3P59666 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
DEFA3P59666 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DEFA3P59666 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
DEFA3P59666 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DEFA3P59666 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DEFA3P59666 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DEFA3P59666 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DEFA3P59666 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DEFA3P59666 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DEFA3P59666 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DEFA3P59666 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DEFA3P59666 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DEFA3P59666 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DEFA3P59666 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DEFA3P59666 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
DEFA3P59666 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DEFA3P59666 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DEFA3P59666 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DEFA3P59666 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DEFA3P59666 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DEFA3P59666 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DEFA3P59666 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DEFA3P59666 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DEFA3P59666 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
DEFA3P59666 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
DEFA3P59666 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.33■■□□□ 1
DEFA3P59666 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
DEFA3P59666 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DEFA3P59666 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DEFA3P59666 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DEFA3P59666 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DEFA3P59666 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DEFA3P59666 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DEFA3P59666 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DEFA3P59666 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DEFA3P59666 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DEFA3P59666 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DEFA3P59666 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DEFA3P59666 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
DEFA3P59666 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DEFA3P59666 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.29■■□□□ 1
DEFA3P59666 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DEFA3P59666 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DEFA3P59666 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
DEFA3P59666 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
DEFA3P59666 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
DEFA3P59666 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DEFA3P59666 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DEFA3P59666 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DEFA3P59666 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DEFA3P59666 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
DEFA3P59666 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DEFA3P59666 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DEFA3P59666 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DEFA3P59666 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DEFA3P59666 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DEFA3P59666 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
DEFA3P59666 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
DEFA3P59666 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DEFA3P59666 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DEFA3P59666 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
DEFA3P59666 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DEFA3P59666 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DEFA3P59666 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DEFA3P59666 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DEFA3P59666 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DEFA3P59666 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DEFA3P59666 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DEFA3P59666 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DEFA3P59666 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DEFA3P59666 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DEFA3P59666 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DEFA3P59666 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DEFA3P59666 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DEFA3P59666 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DEFA3P59666 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DEFA3P59666 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DEFA3P59666 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DEFA3P59666 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DEFA3P59666 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DEFA3P59666 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DEFA3P59666 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DEFA3P59666 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DEFA3P59666 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DEFA3P59666 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DEFA3P59666 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms