Protein–RNA interactions for Protein: P57727

TMPRSS3, Transmembrane protease serine 3, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS3P57727 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMPRSS3P57727 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMPRSS3P57727 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMPRSS3P57727 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMPRSS3P57727 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMPRSS3P57727 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMPRSS3P57727 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMPRSS3P57727 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMPRSS3P57727 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMPRSS3P57727 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMPRSS3P57727 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMPRSS3P57727 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMPRSS3P57727 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMPRSS3P57727 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMPRSS3P57727 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMPRSS3P57727 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMPRSS3P57727 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMPRSS3P57727 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMPRSS3P57727 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMPRSS3P57727 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMPRSS3P57727 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMPRSS3P57727 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMPRSS3P57727 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMPRSS3P57727 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TMPRSS3P57727 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMPRSS3P57727 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMPRSS3P57727 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMPRSS3P57727 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMPRSS3P57727 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMPRSS3P57727 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMPRSS3P57727 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMPRSS3P57727 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMPRSS3P57727 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMPRSS3P57727 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMPRSS3P57727 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMPRSS3P57727 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMPRSS3P57727 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMPRSS3P57727 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMPRSS3P57727 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMPRSS3P57727 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMPRSS3P57727 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMPRSS3P57727 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMPRSS3P57727 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TMPRSS3P57727 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TMPRSS3P57727 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMPRSS3P57727 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMPRSS3P57727 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMPRSS3P57727 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMPRSS3P57727 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMPRSS3P57727 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMPRSS3P57727 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMPRSS3P57727 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMPRSS3P57727 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMPRSS3P57727 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMPRSS3P57727 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMPRSS3P57727 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMPRSS3P57727 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMPRSS3P57727 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMPRSS3P57727 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMPRSS3P57727 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMPRSS3P57727 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMPRSS3P57727 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMPRSS3P57727 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMPRSS3P57727 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMPRSS3P57727 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMPRSS3P57727 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMPRSS3P57727 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMPRSS3P57727 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMPRSS3P57727 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMPRSS3P57727 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMPRSS3P57727 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMPRSS3P57727 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMPRSS3P57727 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMPRSS3P57727 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMPRSS3P57727 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMPRSS3P57727 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMPRSS3P57727 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMPRSS3P57727 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMPRSS3P57727 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMPRSS3P57727 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TMPRSS3P57727 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMPRSS3P57727 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMPRSS3P57727 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TMPRSS3P57727 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMPRSS3P57727 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMPRSS3P57727 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TMPRSS3P57727 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMPRSS3P57727 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMPRSS3P57727 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMPRSS3P57727 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMPRSS3P57727 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TMPRSS3P57727 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TMPRSS3P57727 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMPRSS3P57727 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMPRSS3P57727 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMPRSS3P57727 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMPRSS3P57727 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMPRSS3P57727 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMPRSS3P57727 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TMPRSS3P57727 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms