Protein–RNA interactions for Protein: P56545

CTBP2, C-terminal-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP2P56545 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTBP2P56545 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTBP2P56545 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTBP2P56545 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTBP2P56545 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTBP2P56545 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTBP2P56545 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTBP2P56545 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTBP2P56545 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTBP2P56545 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTBP2P56545 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTBP2P56545 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTBP2P56545 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTBP2P56545 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTBP2P56545 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTBP2P56545 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTBP2P56545 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTBP2P56545 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTBP2P56545 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTBP2P56545 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTBP2P56545 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTBP2P56545 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTBP2P56545 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTBP2P56545 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTBP2P56545 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTBP2P56545 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTBP2P56545 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTBP2P56545 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTBP2P56545 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTBP2P56545 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTBP2P56545 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTBP2P56545 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTBP2P56545 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTBP2P56545 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTBP2P56545 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CTBP2P56545 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CTBP2P56545 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CTBP2P56545 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CTBP2P56545 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CTBP2P56545 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTBP2P56545 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTBP2P56545 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTBP2P56545 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTBP2P56545 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTBP2P56545 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTBP2P56545 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTBP2P56545 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTBP2P56545 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTBP2P56545 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTBP2P56545 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTBP2P56545 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTBP2P56545 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTBP2P56545 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTBP2P56545 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTBP2P56545 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTBP2P56545 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTBP2P56545 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTBP2P56545 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTBP2P56545 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTBP2P56545 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTBP2P56545 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTBP2P56545 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTBP2P56545 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTBP2P56545 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTBP2P56545 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTBP2P56545 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTBP2P56545 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTBP2P56545 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTBP2P56545 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTBP2P56545 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTBP2P56545 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTBP2P56545 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTBP2P56545 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTBP2P56545 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTBP2P56545 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTBP2P56545 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTBP2P56545 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTBP2P56545 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTBP2P56545 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTBP2P56545 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTBP2P56545 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTBP2P56545 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTBP2P56545 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTBP2P56545 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTBP2P56545 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTBP2P56545 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTBP2P56545 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTBP2P56545 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CTBP2P56545 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CTBP2P56545 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTBP2P56545 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTBP2P56545 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CTBP2P56545 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTBP2P56545 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTBP2P56545 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTBP2P56545 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTBP2P56545 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTBP2P56545 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTBP2P56545 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTBP2P56545 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms