Protein–RNA interactions for Protein: P56539

CAV3, Caveolin-3, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV3P56539 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAV3P56539 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CAV3P56539 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CAV3P56539 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAV3P56539 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAV3P56539 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAV3P56539 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAV3P56539 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAV3P56539 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAV3P56539 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CAV3P56539 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAV3P56539 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAV3P56539 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAV3P56539 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAV3P56539 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAV3P56539 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CAV3P56539 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAV3P56539 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAV3P56539 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAV3P56539 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAV3P56539 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAV3P56539 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAV3P56539 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAV3P56539 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAV3P56539 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAV3P56539 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAV3P56539 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAV3P56539 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAV3P56539 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAV3P56539 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAV3P56539 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAV3P56539 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAV3P56539 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAV3P56539 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CAV3P56539 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAV3P56539 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CAV3P56539 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAV3P56539 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAV3P56539 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAV3P56539 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAV3P56539 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAV3P56539 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAV3P56539 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAV3P56539 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAV3P56539 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAV3P56539 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAV3P56539 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CAV3P56539 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAV3P56539 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAV3P56539 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAV3P56539 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAV3P56539 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAV3P56539 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAV3P56539 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAV3P56539 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAV3P56539 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CAV3P56539 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAV3P56539 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAV3P56539 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAV3P56539 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CAV3P56539 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CAV3P56539 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CAV3P56539 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAV3P56539 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAV3P56539 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAV3P56539 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAV3P56539 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAV3P56539 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAV3P56539 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAV3P56539 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAV3P56539 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAV3P56539 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAV3P56539 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAV3P56539 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAV3P56539 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAV3P56539 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAV3P56539 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAV3P56539 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CAV3P56539 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAV3P56539 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAV3P56539 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAV3P56539 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAV3P56539 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAV3P56539 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAV3P56539 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAV3P56539 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CAV3P56539 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CAV3P56539 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAV3P56539 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAV3P56539 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAV3P56539 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAV3P56539 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAV3P56539 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAV3P56539 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAV3P56539 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAV3P56539 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAV3P56539 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAV3P56539 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAV3P56539 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAV3P56539 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms