Protein–RNA interactions for Protein: P55773

CCL23, C-C motif chemokine 23, humanhuman

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL23P55773 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCL23P55773 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCL23P55773 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCL23P55773 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCL23P55773 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCL23P55773 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCL23P55773 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCL23P55773 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCL23P55773 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCL23P55773 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCL23P55773 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CCL23P55773 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCL23P55773 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CCL23P55773 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCL23P55773 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCL23P55773 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CCL23P55773 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCL23P55773 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCL23P55773 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCL23P55773 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCL23P55773 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCL23P55773 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCL23P55773 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCL23P55773 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCL23P55773 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCL23P55773 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCL23P55773 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCL23P55773 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCL23P55773 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCL23P55773 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCL23P55773 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CCL23P55773 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CCL23P55773 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCL23P55773 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCL23P55773 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
CCL23P55773 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CCL23P55773 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CCL23P55773 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CCL23P55773 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
CCL23P55773 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCL23P55773 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCL23P55773 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCL23P55773 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCL23P55773 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCL23P55773 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCL23P55773 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCL23P55773 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCL23P55773 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCL23P55773 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCL23P55773 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCL23P55773 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCL23P55773 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCL23P55773 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCL23P55773 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCL23P55773 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCL23P55773 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCL23P55773 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCL23P55773 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCL23P55773 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCL23P55773 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCL23P55773 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
CCL23P55773 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCL23P55773 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCL23P55773 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCL23P55773 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCL23P55773 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCL23P55773 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCL23P55773 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCL23P55773 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCL23P55773 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CCL23P55773 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCL23P55773 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CCL23P55773 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCL23P55773 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCL23P55773 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCL23P55773 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCL23P55773 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCL23P55773 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCL23P55773 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCL23P55773 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCL23P55773 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCL23P55773 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCL23P55773 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCL23P55773 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCL23P55773 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCL23P55773 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCL23P55773 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCL23P55773 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCL23P55773 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCL23P55773 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCL23P55773 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCL23P55773 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCL23P55773 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCL23P55773 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CCL23P55773 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CCL23P55773 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCL23P55773 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCL23P55773 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCL23P55773 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCL23P55773 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms