Protein–RNA interactions for Protein: P53814

SMTN, Smoothelin, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMTNP53814 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SMTNP53814 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SMTNP53814 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SMTNP53814 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMTNP53814 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMTNP53814 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
SMTNP53814 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMTNP53814 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMTNP53814 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMTNP53814 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMTNP53814 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMTNP53814 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMTNP53814 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMTNP53814 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMTNP53814 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMTNP53814 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMTNP53814 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMTNP53814 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMTNP53814 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMTNP53814 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMTNP53814 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SMTNP53814 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SMTNP53814 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SMTNP53814 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
SMTNP53814 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SMTNP53814 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SMTNP53814 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SMTNP53814 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SMTNP53814 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SMTNP53814 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SMTNP53814 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SMTNP53814 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SMTNP53814 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SMTNP53814 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SMTNP53814 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SMTNP53814 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SMTNP53814 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SMTNP53814 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SMTNP53814 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SMTNP53814 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SMTNP53814 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SMTNP53814 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SMTNP53814 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SMTNP53814 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SMTNP53814 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SMTNP53814 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SMTNP53814 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SMTNP53814 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SMTNP53814 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SMTNP53814 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SMTNP53814 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
SMTNP53814 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SMTNP53814 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SMTNP53814 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SMTNP53814 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SMTNP53814 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SMTNP53814 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SMTNP53814 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SMTNP53814 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SMTNP53814 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SMTNP53814 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SMTNP53814 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SMTNP53814 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SMTNP53814 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SMTNP53814 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
SMTNP53814 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMTNP53814 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMTNP53814 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMTNP53814 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SMTNP53814 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SMTNP53814 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMTNP53814 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMTNP53814 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMTNP53814 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMTNP53814 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMTNP53814 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SMTNP53814 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SMTNP53814 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SMTNP53814 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SMTNP53814 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SMTNP53814 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SMTNP53814 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SMTNP53814 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMTNP53814 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMTNP53814 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMTNP53814 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMTNP53814 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMTNP53814 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMTNP53814 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMTNP53814 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMTNP53814 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMTNP53814 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMTNP53814 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMTNP53814 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMTNP53814 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMTNP53814 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMTNP53814 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMTNP53814 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMTNP53814 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SMTNP53814 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms