Protein–RNA interactions for Protein: P53634

CTSC, Dipeptidyl peptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSCP53634 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTSCP53634 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTSCP53634 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTSCP53634 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTSCP53634 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTSCP53634 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTSCP53634 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CTSCP53634 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTSCP53634 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTSCP53634 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTSCP53634 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CTSCP53634 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTSCP53634 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTSCP53634 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTSCP53634 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTSCP53634 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTSCP53634 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTSCP53634 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTSCP53634 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTSCP53634 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTSCP53634 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTSCP53634 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTSCP53634 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTSCP53634 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTSCP53634 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTSCP53634 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTSCP53634 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CTSCP53634 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTSCP53634 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTSCP53634 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTSCP53634 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTSCP53634 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTSCP53634 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTSCP53634 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CTSCP53634 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTSCP53634 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTSCP53634 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CTSCP53634 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CTSCP53634 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CTSCP53634 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CTSCP53634 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTSCP53634 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTSCP53634 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTSCP53634 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTSCP53634 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTSCP53634 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTSCP53634 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTSCP53634 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTSCP53634 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTSCP53634 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTSCP53634 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTSCP53634 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTSCP53634 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTSCP53634 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTSCP53634 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTSCP53634 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTSCP53634 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTSCP53634 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTSCP53634 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTSCP53634 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTSCP53634 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CTSCP53634 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTSCP53634 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTSCP53634 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTSCP53634 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CTSCP53634 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTSCP53634 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTSCP53634 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTSCP53634 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTSCP53634 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTSCP53634 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTSCP53634 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTSCP53634 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTSCP53634 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTSCP53634 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CTSCP53634 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTSCP53634 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTSCP53634 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTSCP53634 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTSCP53634 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTSCP53634 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTSCP53634 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTSCP53634 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTSCP53634 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTSCP53634 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTSCP53634 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTSCP53634 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CTSCP53634 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTSCP53634 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTSCP53634 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTSCP53634 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTSCP53634 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTSCP53634 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTSCP53634 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTSCP53634 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTSCP53634 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CTSCP53634 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CTSCP53634 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CTSCP53634 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CTSCP53634 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms