Protein–RNA interactions for Protein: P52951

GBX2, Homeobox protein GBX-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX2P52951 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GBX2P52951 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GBX2P52951 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GBX2P52951 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GBX2P52951 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GBX2P52951 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GBX2P52951 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GBX2P52951 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GBX2P52951 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GBX2P52951 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GBX2P52951 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GBX2P52951 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GBX2P52951 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GBX2P52951 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
GBX2P52951 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GBX2P52951 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GBX2P52951 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
GBX2P52951 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GBX2P52951 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GBX2P52951 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GBX2P52951 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GBX2P52951 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GBX2P52951 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GBX2P52951 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GBX2P52951 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GBX2P52951 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GBX2P52951 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GBX2P52951 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GBX2P52951 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GBX2P52951 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GBX2P52951 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
GBX2P52951 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GBX2P52951 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GBX2P52951 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GBX2P52951 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GBX2P52951 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GBX2P52951 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GBX2P52951 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GBX2P52951 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GBX2P52951 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GBX2P52951 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GBX2P52951 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GBX2P52951 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GBX2P52951 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GBX2P52951 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GBX2P52951 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GBX2P52951 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GBX2P52951 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GBX2P52951 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GBX2P52951 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GBX2P52951 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GBX2P52951 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GBX2P52951 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GBX2P52951 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GBX2P52951 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GBX2P52951 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GBX2P52951 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GBX2P52951 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GBX2P52951 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GBX2P52951 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GBX2P52951 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GBX2P52951 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GBX2P52951 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GBX2P52951 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GBX2P52951 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GBX2P52951 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GBX2P52951 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GBX2P52951 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GBX2P52951 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GBX2P52951 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GBX2P52951 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GBX2P52951 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GBX2P52951 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GBX2P52951 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GBX2P52951 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GBX2P52951 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GBX2P52951 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GBX2P52951 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GBX2P52951 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GBX2P52951 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GBX2P52951 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GBX2P52951 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GBX2P52951 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GBX2P52951 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GBX2P52951 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GBX2P52951 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GBX2P52951 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GBX2P52951 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GBX2P52951 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GBX2P52951 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GBX2P52951 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GBX2P52951 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GBX2P52951 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GBX2P52951 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GBX2P52951 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GBX2P52951 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GBX2P52951 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GBX2P52951 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GBX2P52951 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GBX2P52951 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms