Protein–RNA interactions for Protein: P52306

RAP1GDS1, Rap1 GTPase-GDP dissociation stimulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAP1GDS1P52306 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAP1GDS1P52306 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAP1GDS1P52306 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAP1GDS1P52306 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAP1GDS1P52306 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAP1GDS1P52306 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAP1GDS1P52306 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAP1GDS1P52306 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAP1GDS1P52306 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAP1GDS1P52306 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAP1GDS1P52306 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAP1GDS1P52306 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAP1GDS1P52306 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAP1GDS1P52306 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RAP1GDS1P52306 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAP1GDS1P52306 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAP1GDS1P52306 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAP1GDS1P52306 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAP1GDS1P52306 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAP1GDS1P52306 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAP1GDS1P52306 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAP1GDS1P52306 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAP1GDS1P52306 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAP1GDS1P52306 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAP1GDS1P52306 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAP1GDS1P52306 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAP1GDS1P52306 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAP1GDS1P52306 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAP1GDS1P52306 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAP1GDS1P52306 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAP1GDS1P52306 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAP1GDS1P52306 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAP1GDS1P52306 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAP1GDS1P52306 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAP1GDS1P52306 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAP1GDS1P52306 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RAP1GDS1P52306 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAP1GDS1P52306 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAP1GDS1P52306 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAP1GDS1P52306 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAP1GDS1P52306 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAP1GDS1P52306 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RAP1GDS1P52306 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAP1GDS1P52306 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAP1GDS1P52306 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
RAP1GDS1P52306 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAP1GDS1P52306 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAP1GDS1P52306 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAP1GDS1P52306 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAP1GDS1P52306 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAP1GDS1P52306 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAP1GDS1P52306 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAP1GDS1P52306 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAP1GDS1P52306 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
RAP1GDS1P52306 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAP1GDS1P52306 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAP1GDS1P52306 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAP1GDS1P52306 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAP1GDS1P52306 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAP1GDS1P52306 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAP1GDS1P52306 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAP1GDS1P52306 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAP1GDS1P52306 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAP1GDS1P52306 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAP1GDS1P52306 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAP1GDS1P52306 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAP1GDS1P52306 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAP1GDS1P52306 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAP1GDS1P52306 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAP1GDS1P52306 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAP1GDS1P52306 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAP1GDS1P52306 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAP1GDS1P52306 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RAP1GDS1P52306 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
RAP1GDS1P52306 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAP1GDS1P52306 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAP1GDS1P52306 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
RAP1GDS1P52306 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
RAP1GDS1P52306 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAP1GDS1P52306 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAP1GDS1P52306 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAP1GDS1P52306 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAP1GDS1P52306 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAP1GDS1P52306 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAP1GDS1P52306 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAP1GDS1P52306 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAP1GDS1P52306 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAP1GDS1P52306 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAP1GDS1P52306 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAP1GDS1P52306 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAP1GDS1P52306 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAP1GDS1P52306 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
RAP1GDS1P52306 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAP1GDS1P52306 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAP1GDS1P52306 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAP1GDS1P52306 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAP1GDS1P52306 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAP1GDS1P52306 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAP1GDS1P52306 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAP1GDS1P52306 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms