Protein–RNA interactions for Protein: P51449

RORC, Nuclear receptor ROR-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORCP51449 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RORCP51449 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RORCP51449 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RORCP51449 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RORCP51449 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RORCP51449 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RORCP51449 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RORCP51449 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RORCP51449 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RORCP51449 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RORCP51449 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RORCP51449 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RORCP51449 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RORCP51449 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RORCP51449 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RORCP51449 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RORCP51449 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RORCP51449 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RORCP51449 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RORCP51449 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RORCP51449 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RORCP51449 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RORCP51449 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RORCP51449 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RORCP51449 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RORCP51449 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RORCP51449 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RORCP51449 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RORCP51449 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RORCP51449 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RORCP51449 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RORCP51449 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RORCP51449 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RORCP51449 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RORCP51449 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RORCP51449 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RORCP51449 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RORCP51449 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RORCP51449 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RORCP51449 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RORCP51449 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RORCP51449 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RORCP51449 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RORCP51449 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RORCP51449 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RORCP51449 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RORCP51449 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RORCP51449 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RORCP51449 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RORCP51449 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RORCP51449 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RORCP51449 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RORCP51449 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RORCP51449 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RORCP51449 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RORCP51449 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RORCP51449 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RORCP51449 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RORCP51449 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RORCP51449 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RORCP51449 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RORCP51449 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RORCP51449 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RORCP51449 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RORCP51449 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RORCP51449 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RORCP51449 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RORCP51449 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RORCP51449 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RORCP51449 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RORCP51449 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RORCP51449 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RORCP51449 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RORCP51449 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RORCP51449 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RORCP51449 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RORCP51449 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RORCP51449 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RORCP51449 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RORCP51449 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RORCP51449 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RORCP51449 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RORCP51449 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RORCP51449 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RORCP51449 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RORCP51449 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RORCP51449 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RORCP51449 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RORCP51449 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RORCP51449 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RORCP51449 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RORCP51449 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RORCP51449 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RORCP51449 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RORCP51449 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RORCP51449 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RORCP51449 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RORCP51449 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RORCP51449 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RORCP51449 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms