Protein–RNA interactions for Protein: P51168

SCNN1B, Amiloride-sensitive sodium channel subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCNN1BP51168 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCNN1BP51168 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCNN1BP51168 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCNN1BP51168 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCNN1BP51168 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCNN1BP51168 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SCNN1BP51168 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCNN1BP51168 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCNN1BP51168 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCNN1BP51168 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCNN1BP51168 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCNN1BP51168 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCNN1BP51168 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCNN1BP51168 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCNN1BP51168 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SCNN1BP51168 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCNN1BP51168 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCNN1BP51168 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCNN1BP51168 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCNN1BP51168 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCNN1BP51168 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCNN1BP51168 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCNN1BP51168 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCNN1BP51168 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCNN1BP51168 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCNN1BP51168 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCNN1BP51168 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCNN1BP51168 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCNN1BP51168 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCNN1BP51168 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCNN1BP51168 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCNN1BP51168 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCNN1BP51168 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCNN1BP51168 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCNN1BP51168 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCNN1BP51168 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCNN1BP51168 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCNN1BP51168 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCNN1BP51168 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCNN1BP51168 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SCNN1BP51168 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCNN1BP51168 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCNN1BP51168 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCNN1BP51168 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCNN1BP51168 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCNN1BP51168 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCNN1BP51168 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCNN1BP51168 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCNN1BP51168 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCNN1BP51168 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCNN1BP51168 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCNN1BP51168 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCNN1BP51168 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCNN1BP51168 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCNN1BP51168 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCNN1BP51168 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCNN1BP51168 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCNN1BP51168 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCNN1BP51168 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCNN1BP51168 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SCNN1BP51168 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SCNN1BP51168 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCNN1BP51168 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCNN1BP51168 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCNN1BP51168 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCNN1BP51168 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCNN1BP51168 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCNN1BP51168 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCNN1BP51168 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCNN1BP51168 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCNN1BP51168 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCNN1BP51168 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCNN1BP51168 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCNN1BP51168 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCNN1BP51168 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCNN1BP51168 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCNN1BP51168 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCNN1BP51168 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCNN1BP51168 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCNN1BP51168 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCNN1BP51168 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCNN1BP51168 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCNN1BP51168 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCNN1BP51168 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCNN1BP51168 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCNN1BP51168 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCNN1BP51168 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SCNN1BP51168 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCNN1BP51168 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCNN1BP51168 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCNN1BP51168 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCNN1BP51168 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCNN1BP51168 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SCNN1BP51168 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCNN1BP51168 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCNN1BP51168 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCNN1BP51168 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCNN1BP51168 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCNN1BP51168 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SCNN1BP51168 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms