Protein–RNA interactions for Protein: P50748

KNTC1, Kinetochore-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNTC1P50748 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
KNTC1P50748 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
KNTC1P50748 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
KNTC1P50748 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KNTC1P50748 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KNTC1P50748 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KNTC1P50748 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
KNTC1P50748 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KNTC1P50748 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KNTC1P50748 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KNTC1P50748 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KNTC1P50748 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KNTC1P50748 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KNTC1P50748 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KNTC1P50748 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KNTC1P50748 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KNTC1P50748 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KNTC1P50748 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KNTC1P50748 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KNTC1P50748 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KNTC1P50748 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KNTC1P50748 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KNTC1P50748 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KNTC1P50748 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KNTC1P50748 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KNTC1P50748 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KNTC1P50748 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KNTC1P50748 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KNTC1P50748 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KNTC1P50748 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KNTC1P50748 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KNTC1P50748 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KNTC1P50748 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KNTC1P50748 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KNTC1P50748 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
KNTC1P50748 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
KNTC1P50748 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KNTC1P50748 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
KNTC1P50748 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KNTC1P50748 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KNTC1P50748 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KNTC1P50748 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KNTC1P50748 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KNTC1P50748 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KNTC1P50748 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KNTC1P50748 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KNTC1P50748 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KNTC1P50748 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KNTC1P50748 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KNTC1P50748 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KNTC1P50748 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KNTC1P50748 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KNTC1P50748 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KNTC1P50748 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
KNTC1P50748 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KNTC1P50748 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KNTC1P50748 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KNTC1P50748 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KNTC1P50748 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KNTC1P50748 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KNTC1P50748 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KNTC1P50748 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KNTC1P50748 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KNTC1P50748 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KNTC1P50748 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KNTC1P50748 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KNTC1P50748 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KNTC1P50748 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KNTC1P50748 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KNTC1P50748 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KNTC1P50748 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KNTC1P50748 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KNTC1P50748 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KNTC1P50748 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KNTC1P50748 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KNTC1P50748 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KNTC1P50748 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KNTC1P50748 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KNTC1P50748 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
KNTC1P50748 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KNTC1P50748 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KNTC1P50748 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KNTC1P50748 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KNTC1P50748 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KNTC1P50748 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KNTC1P50748 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KNTC1P50748 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KNTC1P50748 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KNTC1P50748 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
KNTC1P50748 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KNTC1P50748 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KNTC1P50748 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KNTC1P50748 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KNTC1P50748 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KNTC1P50748 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KNTC1P50748 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KNTC1P50748 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
KNTC1P50748 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
KNTC1P50748 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KNTC1P50748 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms