Protein–RNA interactions for Protein: P49721

PSMB2, Proteasome subunit beta type-2, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB2P49721 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSMB2P49721 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMB2P49721 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMB2P49721 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMB2P49721 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMB2P49721 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMB2P49721 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMB2P49721 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PSMB2P49721 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMB2P49721 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMB2P49721 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMB2P49721 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PSMB2P49721 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSMB2P49721 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSMB2P49721 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSMB2P49721 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSMB2P49721 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSMB2P49721 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSMB2P49721 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSMB2P49721 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSMB2P49721 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSMB2P49721 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSMB2P49721 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMB2P49721 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMB2P49721 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMB2P49721 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMB2P49721 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMB2P49721 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMB2P49721 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMB2P49721 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMB2P49721 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMB2P49721 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMB2P49721 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMB2P49721 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PSMB2P49721 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
PSMB2P49721 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
PSMB2P49721 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMB2P49721 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMB2P49721 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMB2P49721 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMB2P49721 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMB2P49721 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMB2P49721 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMB2P49721 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMB2P49721 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMB2P49721 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMB2P49721 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMB2P49721 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMB2P49721 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMB2P49721 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMB2P49721 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMB2P49721 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PSMB2P49721 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMB2P49721 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMB2P49721 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMB2P49721 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMB2P49721 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMB2P49721 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMB2P49721 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMB2P49721 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PSMB2P49721 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSMB2P49721 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSMB2P49721 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSMB2P49721 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSMB2P49721 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSMB2P49721 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSMB2P49721 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSMB2P49721 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PSMB2P49721 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PSMB2P49721 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PSMB2P49721 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PSMB2P49721 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PSMB2P49721 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PSMB2P49721 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PSMB2P49721 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PSMB2P49721 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PSMB2P49721 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PSMB2P49721 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PSMB2P49721 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PSMB2P49721 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PSMB2P49721 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PSMB2P49721 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PSMB2P49721 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PSMB2P49721 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PSMB2P49721 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PSMB2P49721 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PSMB2P49721 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PSMB2P49721 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PSMB2P49721 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PSMB2P49721 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMB2P49721 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMB2P49721 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMB2P49721 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMB2P49721 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMB2P49721 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMB2P49721 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMB2P49721 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMB2P49721 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMB2P49721 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PSMB2P49721 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms