Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.32■■■■■ 4.53
NESP48681 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.32■■■■■ 4.53
NESP48681 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.31■■■■■ 4.52
NESP48681 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.31■■■■■ 4.52
NESP48681 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC43.3■■■■■ 4.52
NESP48681 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC43.29■■■■■ 4.52
NESP48681 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC43.29■■■■■ 4.52
NESP48681 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC43.29■■■■■ 4.52
NESP48681 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC43.28■■■■■ 4.52
NESP48681 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.27■■■■■ 4.52
NESP48681 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC43.27■■■■■ 4.52
NESP48681 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC43.27■■■■■ 4.52
NESP48681 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC43.26■■■■■ 4.52
NESP48681 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.26■■■■■ 4.52
NESP48681 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC43.25■■■■■ 4.51
NESP48681 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.25■■■■■ 4.51
NESP48681 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC43.25■■■■■ 4.51
NESP48681 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.24■■■■■ 4.51
NESP48681 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC43.24■■■■■ 4.51
NESP48681 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC43.24■■■■■ 4.51
NESP48681 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC43.24■■■■■ 4.51
NESP48681 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.23■■■■■ 4.51
NESP48681 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.23■■■■■ 4.51
NESP48681 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC43.23■■■■■ 4.51
NESP48681 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC43.22■■■■■ 4.51
NESP48681 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC43.22■■■■■ 4.51
NESP48681 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC43.22■■■■■ 4.51
NESP48681 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC43.22■■■■■ 4.51
NESP48681 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC43.22■■■■■ 4.51
NESP48681 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.21■■■■■ 4.51
NESP48681 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.21■■■■■ 4.51
NESP48681 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC43.2■■■■■ 4.51
NESP48681 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC43.2■■■■■ 4.51
NESP48681 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC43.19■■■■■ 4.51
NESP48681 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC43.19■■■■■ 4.51
NESP48681 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC43.19■■■■■ 4.5
NESP48681 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC43.18■■■■■ 4.5
NESP48681 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.17■■■■■ 4.5
NESP48681 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC43.16■■■■■ 4.5
NESP48681 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC43.16■■■■■ 4.5
NESP48681 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC43.15■■■■■ 4.5
NESP48681 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC43.15■■■■■ 4.5
NESP48681 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.14■■■■■ 4.5
NESP48681 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.13■■■■■ 4.5
NESP48681 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC43.13■■■■■ 4.5
NESP48681 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.13■■■■■ 4.49
NESP48681 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC43.13■■■■■ 4.49
NESP48681 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.13■■■■■ 4.49
NESP48681 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC43.12■■■■■ 4.49
NESP48681 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.12■■■■■ 4.49
NESP48681 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC43.11■■■■■ 4.49
NESP48681 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC43.11■■■■■ 4.49
NESP48681 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC43.11■■■■■ 4.49
NESP48681 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.11■■■■■ 4.49
NESP48681 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC43.11■■■■■ 4.49
NESP48681 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC43.1■■■■■ 4.49
NESP48681 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.1■■■■■ 4.49
NESP48681 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC43.09■■■■■ 4.49
NESP48681 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC43.09■■■■■ 4.49
NESP48681 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC43.09■■■■■ 4.49
NESP48681 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.09■■■■■ 4.49
NESP48681 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.08■■■■■ 4.49
NESP48681 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC43.08■■■■■ 4.49
NESP48681 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC43.08■■■■■ 4.49
NESP48681 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC43.08■■■■■ 4.49
NESP48681 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC43.08■■■■■ 4.49
NESP48681 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.08■■■■■ 4.49
NESP48681 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.08■■■■■ 4.49
NESP48681 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC43.08■■■■■ 4.49
NESP48681 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC43.08■■■■■ 4.49
NESP48681 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC43.07■■■■■ 4.49
NESP48681 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC43.07■■■■■ 4.48
NESP48681 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC43.07■■■■■ 4.48
NESP48681 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC43.07■■■■■ 4.48
NESP48681 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC43.07■■■■■ 4.48
NESP48681 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC43.07■■■■■ 4.48
NESP48681 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC43.07■■■■■ 4.48
NESP48681 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.07■■■■■ 4.48
NESP48681 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.06■■■■■ 4.48
NESP48681 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC43.05■■■■■ 4.48
NESP48681 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC43.04■■■■■ 4.48
NESP48681 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC43.04■■■■■ 4.48
NESP48681 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.04■■■■■ 4.48
NESP48681 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC43.04■■■■■ 4.48
NESP48681 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC43.04■■■■■ 4.48
NESP48681 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC43.03■■■■■ 4.48
NESP48681 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.03■■■■■ 4.48
NESP48681 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC43.03■■■■■ 4.48
NESP48681 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC43.03■■■■■ 4.48
NESP48681 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.03■■■■■ 4.48
NESP48681 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.02■■■■■ 4.48
NESP48681 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC43.02■■■■■ 4.48
NESP48681 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.02■■■■■ 4.48
NESP48681 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC43.01■■■■■ 4.48
NESP48681 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.01■■■■■ 4.48
NESP48681 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC43.01■■■■■ 4.48
NESP48681 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43■■■■■ 4.47
NESP48681 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43■■■■■ 4.47
NESP48681 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43■■■■■ 4.47
NESP48681 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC42.99■■■■■ 4.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms