Protein–RNA interactions for Protein: P48544

KCNJ5, G protein-activated inward rectifier potassium channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNJ5P48544 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCNJ5P48544 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCNJ5P48544 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCNJ5P48544 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCNJ5P48544 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
KCNJ5P48544 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
KCNJ5P48544 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
KCNJ5P48544 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
KCNJ5P48544 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KCNJ5P48544 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KCNJ5P48544 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KCNJ5P48544 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KCNJ5P48544 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNJ5P48544 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNJ5P48544 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNJ5P48544 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNJ5P48544 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCNJ5P48544 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCNJ5P48544 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCNJ5P48544 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNJ5P48544 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNJ5P48544 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNJ5P48544 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNJ5P48544 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNJ5P48544 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNJ5P48544 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNJ5P48544 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNJ5P48544 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNJ5P48544 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNJ5P48544 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNJ5P48544 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNJ5P48544 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNJ5P48544 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNJ5P48544 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNJ5P48544 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNJ5P48544 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNJ5P48544 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNJ5P48544 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNJ5P48544 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNJ5P48544 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNJ5P48544 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNJ5P48544 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNJ5P48544 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNJ5P48544 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNJ5P48544 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNJ5P48544 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNJ5P48544 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNJ5P48544 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNJ5P48544 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNJ5P48544 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNJ5P48544 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNJ5P48544 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNJ5P48544 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNJ5P48544 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNJ5P48544 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNJ5P48544 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNJ5P48544 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNJ5P48544 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KCNJ5P48544 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNJ5P48544 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNJ5P48544 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNJ5P48544 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNJ5P48544 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNJ5P48544 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNJ5P48544 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNJ5P48544 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNJ5P48544 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNJ5P48544 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNJ5P48544 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNJ5P48544 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNJ5P48544 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNJ5P48544 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNJ5P48544 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNJ5P48544 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNJ5P48544 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNJ5P48544 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNJ5P48544 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNJ5P48544 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNJ5P48544 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNJ5P48544 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNJ5P48544 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNJ5P48544 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNJ5P48544 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNJ5P48544 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCNJ5P48544 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCNJ5P48544 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCNJ5P48544 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCNJ5P48544 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCNJ5P48544 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCNJ5P48544 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
KCNJ5P48544 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCNJ5P48544 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNJ5P48544 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNJ5P48544 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNJ5P48544 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNJ5P48544 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNJ5P48544 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNJ5P48544 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNJ5P48544 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNJ5P48544 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms