Protein–RNA interactions for Protein: P42785

PRCP, Lysosomal Pro-X carboxypeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRCPP42785 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
PRCPP42785 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRCPP42785 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRCPP42785 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PRCPP42785 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PRCPP42785 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PRCPP42785 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PRCPP42785 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PRCPP42785 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PRCPP42785 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRCPP42785 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
PRCPP42785 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRCPP42785 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRCPP42785 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRCPP42785 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRCPP42785 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRCPP42785 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRCPP42785 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRCPP42785 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRCPP42785 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRCPP42785 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PRCPP42785 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRCPP42785 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRCPP42785 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRCPP42785 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRCPP42785 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRCPP42785 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRCPP42785 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRCPP42785 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRCPP42785 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
PRCPP42785 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PRCPP42785 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PRCPP42785 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRCPP42785 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRCPP42785 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRCPP42785 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRCPP42785 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRCPP42785 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRCPP42785 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRCPP42785 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRCPP42785 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRCPP42785 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRCPP42785 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRCPP42785 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRCPP42785 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRCPP42785 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRCPP42785 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRCPP42785 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRCPP42785 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRCPP42785 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRCPP42785 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRCPP42785 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRCPP42785 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRCPP42785 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRCPP42785 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRCPP42785 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRCPP42785 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PRCPP42785 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PRCPP42785 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PRCPP42785 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PRCPP42785 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PRCPP42785 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRCPP42785 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PRCPP42785 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRCPP42785 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRCPP42785 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRCPP42785 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRCPP42785 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRCPP42785 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRCPP42785 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRCPP42785 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRCPP42785 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRCPP42785 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRCPP42785 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRCPP42785 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRCPP42785 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PRCPP42785 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRCPP42785 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRCPP42785 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRCPP42785 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRCPP42785 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRCPP42785 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRCPP42785 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
PRCPP42785 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRCPP42785 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRCPP42785 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRCPP42785 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRCPP42785 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRCPP42785 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRCPP42785 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRCPP42785 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRCPP42785 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRCPP42785 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRCPP42785 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRCPP42785 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRCPP42785 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRCPP42785 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRCPP42785 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRCPP42785 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRCPP42785 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms